{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037577335776652],
[428.6002142774645, 1087.076117299136, 0, 1, 0.2827781930404867, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.7172218069595133, 1, 0.0006037611693669203],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.0006035238907185894],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000603761152698658],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.0006035239094499065],
[428.5667926989542, 1087.277562361002, 0, 1, 0.2827248003849334, 0, 0.0009197283514510496, 0.01835555863769117, 0.7172751996150666, 1, 0.0006036344187864124],
[428.4321907941087, 1087.412164265847, 0, 1, 0.2826360037321661, 0, 0.0009196145057611502, 0.01835328655242459, 0.7173639962678339, 1, 0.0006037611522254548],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037611523039109],
[428.3305335158269, 1087.513821544129, 0, 1, 0.282568940594752, 0, 0.0009195285431684252, 0.01835157094649711, 0.717431059405248, 1, 0.0006037416723239634],
[428.4656123726191, 1087.244140782492, 1, 0, 0.282683153209724, 0.002333909586028436, 0, -0.04657920373317378, 1, 0.282683153209724, 0.0006037611402707901],
[428.7682377608204, 1087.076117299136, 0, 1, 0.282857693357219, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.717142306642781, 1, 0.000603632803242937],
[428.7348161823101, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2828105325688004, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828105325688004, 0.0006035908129422634],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 0, 0.2827468485446925, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002847343469794562],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0003188605669359261],
[428.5008872616285, 1087.559258885792, 0, 0, 0.2826410867342735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002721903553531351],
[428.5505507695465, 1087.401699834142, 1, 0, 0.2826939638757668, 0.002333447006903396, 0, -0.04656997177001763, 1, 0.2826939638757668, 0.0003313338087850944],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037667779187321],
[428.6856296263388, 1087.098597493994, 0, 1, 0.2828144151102234, 0, 0.0009198797627972517, 0.01835858044281356, 0.7171855848897766, 1, 0.0005996921465559926],
[428.9923187337322, 1086.852036326224, 0, 1, 0.2830055192023751, 0, 0.0009200884449553953, 0.01836274523515078, 0.716994480797625, 1, 0.0006036329562931084],
[428.3310104677736, 1087.513344592182, 0, 0, 0.282569255239158, 0, 0, 0, 1, 1, 1.137545495194441e-05],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0005921514381417838],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.000603834334262087],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 0, 0.2827468485446925, 0, 0, 0, 1, 1, 4.195460266976833e-05],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0005620988570517006],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037289611698565],
[428.2352931342568, 1087.441038442344, 1, 0, 0.2825374284817182, 0.002335164840527257, 0, -0.04660425558410562, 1, 0.2825374284817181, 0.0006038004466378945],
[428.5667926989542, 1087.253809206201, 0, 1, 0.2827292307284326, 0, 0.0009197484446893734, 0.01835595965024417, 0.7172707692715674, 1, 0.0006035175105410035],
[428.6098827011738, 1087.234472358782, 0, 1, 0.2827532267877338, 0, 0.0009197648027388934, 0.01835628611744145, 0.7172467732122663, 1, 0.0006038698666977315],
[428.5667926989542, 1087.277562361002, 0, 1, 0.2827248003849334, 0, 0.0009197283514510496, 0.01835555863769117, 0.7172751996150666, 1, 0.0006037925927164228],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006037900054330483],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000603738870333527],
[428.7682377608205, 1087.076117299136, 0, 1, 0.282857693357219, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.717142306642781, 1, 0.0006036051841247877],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037881915348023],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006037837718878874],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006038825573879998],
[428.4656123726191, 1087.342367902515, 1, 0, 0.2826648348261424, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826648348261424, 0.0006038967735580186],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028436, 0, -0.04657920373317378, 1, 0.2826580518919253, 0.0006038946992598555],
[428.3305335158269, 1087.513821544129, 0, 1, 0.282568940594752, 0, 0.0009195285431684252, 0.01835157094649711, 0.717431059405248, 1, 0.0006040373749191642],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006035720585310251],
[428.3305335158269, 1087.513821544129, 0, 1, 0.282568940594752, 0, 0.0009195285431684252, 0.01835157094649711, 0.717431059405248, 1, 0.0006038234181039961],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006039022367825012],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006036771657641062],
[428.6002142774645, 1087.210719203981, 0, 1, 0.282753082729833, 0, 0.0009197848975699633, 0.01835668716178181, 0.717246917270167, 1, 0.0006037937955813547],
[428.6002142774645, 1087.076117299136, 0, 1, 0.2827781930404867, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.7172218069595133, 1, 0.0006036724979429994],
[428.6002142774645, 1087.177297625471, 0, 0, 0.2827593171898901, 0, 0, 0, 1, 1, 1.094448410935108e-06],
[428.6002142774645, 1087.210719203981, 0, 1, 0.282753082729833, 0, 0.0009197848975699633, 0.01835668716178181, 0.717246917270167, 1, 0.000602425169982781],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006038272210807507],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037043588189753],
[428.7348161823101, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2828105325688004, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828105325688004, 0.0006036552690414952],
[428.5905458537554, 1087.253809206201, 0, 1, 0.2827404703016513, 0, 0.0009197484446893734, 0.01835595965024417, 0.7172595296983486, 1, 0.0006037583970737823],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.0006038774344616743],
[428.1336358559749, 1087.710719203981, 1, 0, 0.2824390475360123, 0.002335719308763683, 0, -0.04661532143220129, 1, 0.2824390475360123, 0.00060371539598448],
[428.4321907941087, 1087.412164265847, 0, 1, 0.2826360037321661, 0, 0.0009196145057611502, 0.01835328655242459, 0.7173639962678339, 1, 0.000603727368022601],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006035591893539794],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006036762085877416],
[428.3806739756916, 1087.463681084264, 1, 0, 0.2826020181727351, 0.002334372348591862, 0, -0.04658843935731746, 1, 0.2826020181727351, 0.0006038168076168908],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006038873658673436],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037906234936397],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006036717745525406],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006038948698351456],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006035625549497397],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000603622836579207],
[428.7682377608204, 1087.076117299136, 0, 1, 0.282857693357219, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.717142306642781, 1, 0.0006037106838400519],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006036591718214173],
[428.2352931342568, 1087.441038442344, 1, 0, 0.2825374284817182, 0.002335164840527257, 0, -0.04660425558410562, 1, 0.2825374284817181, 0.0006038844496553626],
[428.9923187337322, 1086.852036326224, 0, 1, 0.2830055192023751, 0, 0.0009200884449553953, 0.01836274523515078, 0.716994480797625, 1, 0.0006039908345443283],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006039919895720383],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006039733160949114],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006035579025210528],
[428.6002142774645, 1086.98093924725, 1, 0, 0.2827959514280641, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827959514280641, 0.0006040013224960935],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006035561912633772],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.000603911981035103],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006037473146185315],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006037526861218232],
[428.7121735403891, 1087.311966935488, 0, 1, 0.2827871681553945, 0, 0.000919699249534087, 0.01835497783365003, 0.7172128318446056, 1, 0.0006034356138433142],
[428.4321907941088, 1087.412164265847, 0, 1, 0.2826360037321661, 0, 0.0009196145057611502, 0.01835328655242459, 0.7173639962678339, 1, 0.0006036872155460461],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006035582660816125],
[428.4923187337323, 1087.352036326224, 0, 1, 0.2826756700339358, 0, 0.000919665358220733, 0.01835430144481348, 0.7173243299660642, 1, 0.0006038892892315855],
[428.4321907941087, 1087.352036326224, 0, 1, 0.2826472153019027, 0, 0.000919665358220733, 0.01835430144481348, 0.7173527846980974, 1, 0.0006037802650527606],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 0, 0.2827468485446925, 0, 0, 0, 1, 1, 9.30942425918545e-05],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000510444920753885],
[428.4656123726191, 1087.244140782492, 1, 0, 0.282683153209724, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.282683153209724, 0.0006035625143512663],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006039581116143815],
[428.712173540389, 1087.311966935488, 0, 1, 0.2827871681553944, 0, 0.000919699249534087, 0.01835497783365003, 0.7172128318446056, 1, 0.0006037495529322641],
[428.6498777853826, 1087.194477274574, 1, 0, 0.2827796114782696, 0.002332906299114081, 0, -0.04655918054724304, 1, 0.2827796114782697, 0.0006038552344014358],
[428.4656123726191, 1087.342367902515, 1, 0, 0.2826648348261424, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826648348261424, 0.000603565152532342],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028436, 0, -0.04657920373317378, 1, 0.2826580518919253, 0.000603817748632445],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006038718285892473],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006035779805582303]
],
"NAMES": [
["Node1025"],
["Node547"],
["Node535"],
["Node532"],
["Node177"],
["Node174"],
["Node529"],
["Node186"],
["Node189"],
["Node526"],
["Node502"],
["Node245"],
["Node266"],
["Node265"],
["Node256"],
["Node255"],
["Node276"],
["Node451"],
["Node433"],
["Node429"],
["Node428"],
["Node423"],
["Node419"],
["Node418"],
["Node408"],
["Node405"],
["Node398"],
["Node393"],
["Node390"],
["Node387"],
["Node383"],
["Node380"],
["Node377"],
["Node374"],
["Node371"],
["Node368"],
["Node365"],
["Node362"],
["Node359"],
["Node353"],
["Node350"],
["Node311"],
["Node356"],
["Node414"],
["Node442"],
["Node441"],
["Node447"],
["Node455"],
["Node523"],
["Node520"],
["Node541"],
["Node551"],
["Node699"],
["Node599"],
["Node570"],
["Node132"],
["Node130"],
["Node109"],
["Node586"],
["Node592"],
["Node595"],
["Node666"],
["Node655"],
["Node633"],
["Node609"],
["Node630"],
["Node64"],
["Node637"],
["Node642"],
["Node645"],
["Node649"],
["Node652"],
["Node676"],
["Node681"],
["Node685"],
["Node695"],
["Node691"],
["Node709"],
["Node705"],
["Node734"],
["Node733"],
["Node730"],
["Node720"],
["Node727"],
["Node749"],
["Node90"],
["Node86"],
["Node889"],
["Node1"]
],
"RESOLVED": [
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037577335776652],
[428.6002142774645, 1087.076117299136, 0, 1, 0.2827781930404867, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.7172218069595133, 1, 0.0006037611693669203],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.0006035238907185894],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000603761152698658],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.0006035239094499065],
[428.5667926989542, 1087.277562361002, 0, 1, 0.2827248003849334, 0, 0.0009197283514510496, 0.01835555863769117, 0.7172751996150666, 1, 0.0006036344187864124],
[428.4321907941087, 1087.412164265847, 0, 1, 0.2826360037321661, 0, 0.0009196145057611502, 0.01835328655242459, 0.7173639962678339, 1, 0.0006037611522254548],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037611523039109],
[428.3305335158269, 1087.513821544129, 0, 1, 0.282568940594752, 0, 0.0009195285431684252, 0.01835157094649711, 0.717431059405248, 1, 0.0006037416723239634],
[428.4656123726191, 1087.244140782492, 1, 0, 0.282683153209724, 0.002333909586028436, 0, -0.04657920373317378, 1, 0.282683153209724, 0.0006037611402707901],
[428.7682377608204, 1087.076117299136, 0, 1, 0.282857693357219, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.717142306642781, 1, 0.000603632803242937],
[428.7348161823101, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2828105325688004, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828105325688004, 0.0006035908129422634],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 0, 0.2827468485446925, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002847343469794562],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0003188605669359261],
[428.5008872616285, 1087.559258885792, 0, 0, 0.2826410867342735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002721903553531351],
[428.5505507695465, 1087.401699834142, 1, 0, 0.2826939638757668, 0.002333447006903396, 0, -0.04656997177001763, 1, 0.2826939638757668, 0.0003313338087850944],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037667779187321],
[428.6856296263388, 1087.098597493994, 0, 1, 0.2828144151102234, 0, 0.0009198797627972517, 0.01835858044281356, 0.7171855848897766, 1, 0.0005996921465559926],
[428.9923187337322, 1086.852036326224, 0, 1, 0.2830055192023751, 0, 0.0009200884449553953, 0.01836274523515078, 0.716994480797625, 1, 0.0006036329562931084],
[428.3310104677736, 1087.513344592182, 0, 0, 0.282569255239158, 0, 0, 0, 1, 1, 1.137545495194441e-05],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0005921514381417838],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.000603834334262087],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 0, 0.2827468485446925, 0, 0, 0, 1, 1, 4.195460266976833e-05],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0005620988570517006],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037289611698565],
[428.2352931342568, 1087.441038442344, 1, 0, 0.2825374284817182, 0.002335164840527257, 0, -0.04660425558410562, 1, 0.2825374284817181, 0.0006038004466378945],
[428.5667926989542, 1087.253809206201, 0, 1, 0.2827292307284326, 0, 0.0009197484446893734, 0.01835595965024417, 0.7172707692715674, 1, 0.0006035175105410035],
[428.6098827011738, 1087.234472358782, 0, 1, 0.2827532267877338, 0, 0.0009197648027388934, 0.01835628611744145, 0.7172467732122663, 1, 0.0006038698666977315],
[428.5667926989542, 1087.277562361002, 0, 1, 0.2827248003849334, 0, 0.0009197283514510496, 0.01835555863769117, 0.7172751996150666, 1, 0.0006037925927164228],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006037900054330483],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000603738870333527],
[428.7682377608205, 1087.076117299136, 0, 1, 0.282857693357219, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.717142306642781, 1, 0.0006036051841247877],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037881915348023],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006037837718878874],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006038825573879998],
[428.4656123726191, 1087.342367902515, 1, 0, 0.2826648348261424, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826648348261424, 0.0006038967735580186],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028436, 0, -0.04657920373317378, 1, 0.2826580518919253, 0.0006038946992598555],
[428.3305335158269, 1087.513821544129, 0, 1, 0.282568940594752, 0, 0.0009195285431684252, 0.01835157094649711, 0.717431059405248, 1, 0.0006040373749191642],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006035720585310251],
[428.3305335158269, 1087.513821544129, 0, 1, 0.282568940594752, 0, 0.0009195285431684252, 0.01835157094649711, 0.717431059405248, 1, 0.0006038234181039961],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006039022367825012],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006036771657641062],
[428.6002142774645, 1087.210719203981, 0, 1, 0.282753082729833, 0, 0.0009197848975699633, 0.01835668716178181, 0.717246917270167, 1, 0.0006037937955813547],
[428.6002142774645, 1087.076117299136, 0, 1, 0.2827781930404867, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.7172218069595133, 1, 0.0006036724979429994],
[428.6002142774645, 1087.177297625471, 0, 0, 0.2827593171898901, 0, 0, 0, 1, 1, 1.094448410935108e-06],
[428.6002142774645, 1087.210719203981, 0, 1, 0.282753082729833, 0, 0.0009197848975699633, 0.01835668716178181, 0.717246917270167, 1, 0.000602425169982781],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006038272210807507],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037043588189753],
[428.7348161823101, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2828105325688004, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828105325688004, 0.0006036552690414952],
[428.5905458537554, 1087.253809206201, 0, 1, 0.2827404703016513, 0, 0.0009197484446893734, 0.01835595965024417, 0.7172595296983486, 1, 0.0006037583970737823],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.0006038774344616743],
[428.1336358559749, 1087.710719203981, 1, 0, 0.2824390475360123, 0.002335719308763683, 0, -0.04661532143220129, 1, 0.2824390475360123, 0.00060371539598448],
[428.4321907941087, 1087.412164265847, 0, 1, 0.2826360037321661, 0, 0.0009196145057611502, 0.01835328655242459, 0.7173639962678339, 1, 0.000603727368022601],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006035591893539794],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006036762085877416],
[428.3806739756916, 1087.463681084264, 1, 0, 0.2826020181727351, 0.002334372348591862, 0, -0.04658843935731746, 1, 0.2826020181727351, 0.0006038168076168908],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006038873658673436],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006037906234936397],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006036717745525406],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006038948698351456],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006035625549497397],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000603622836579207],
[428.7682377608204, 1087.076117299136, 0, 1, 0.282857693357219, 0, 0.0009198987854544371, 0.01835896008915029, 0.717142306642781, 1, 0.0006037106838400519],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006036591718214173],
[428.2352931342568, 1087.441038442344, 1, 0, 0.2825374284817182, 0.002335164840527257, 0, -0.04660425558410562, 1, 0.2825374284817181, 0.0006038844496553626],
[428.9923187337322, 1086.852036326224, 0, 1, 0.2830055192023751, 0, 0.0009200884449553953, 0.01836274523515078, 0.716994480797625, 1, 0.0006039908345443283],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006039919895720383],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006039733160949114],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006035579025210528],
[428.6002142774645, 1086.98093924725, 1, 0, 0.2827959514280641, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827959514280641, 0.0006040013224960935],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006035561912633772],
[428.7348161823101, 1087.109538877646, 1, 0, 0.2828356451974598, 0.002332444117565605, 0, -0.04654995651875579, 1, 0.2828356451974599, 0.000603911981035103],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006037473146185315],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006037526861218232],
[428.7121735403891, 1087.311966935488, 0, 1, 0.2827871681553945, 0, 0.000919699249534087, 0.01835497783365003, 0.7172128318446056, 1, 0.0006034356138433142],
[428.4321907941088, 1087.412164265847, 0, 1, 0.2826360037321661, 0, 0.0009196145057611502, 0.01835328655242459, 0.7173639962678339, 1, 0.0006036872155460461],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006035582660816125],
[428.4923187337323, 1087.352036326224, 0, 1, 0.2826756700339358, 0, 0.000919665358220733, 0.01835430144481348, 0.7173243299660642, 1, 0.0006038892892315855],
[428.4321907941087, 1087.352036326224, 0, 1, 0.2826472153019027, 0, 0.000919665358220733, 0.01835430144481348, 0.7173527846980974, 1, 0.0006037802650527606],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 0, 0.2827468485446925, 0, 0, 0, 1, 1, 9.30942425918545e-05],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.000510444920753885],
[428.4656123726191, 1087.244140782492, 1, 0, 0.282683153209724, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.282683153209724, 0.0006035625143512663],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 0, 1, 0.2827468485446925, 0, 0.0009197566236414005, 0.01835612288239124, 0.7172531514553075, 1, 0.0006039581116143815],
[428.712173540389, 1087.311966935488, 0, 1, 0.2827871681553944, 0, 0.000919699249534087, 0.01835497783365003, 0.7172128318446056, 1, 0.0006037495529322641],
[428.6498777853826, 1087.194477274574, 1, 0, 0.2827796114782696, 0.002332906299114081, 0, -0.04655918054724304, 1, 0.2827796114782697, 0.0006038552344014358],
[428.4656123726191, 1087.342367902515, 1, 0, 0.2826648348261424, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826648348261424, 0.000603565152532342],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028436, 0, -0.04657920373317378, 1, 0.2826580518919253, 0.000603817748632445],
[428.6002142774645, 1087.244140782492, 1, 0, 0.2827468485446925, 0.002333176621681823, 0, -0.04656457553342069, 1, 0.2827468485446925, 0.0006038718285892473],
[428.4656123726191, 1087.378742687337, 1, 0, 0.2826580518919253, 0.002333909586028437, 0, -0.04657920373317379, 1, 0.2826580518919253, 0.0006035779805582303]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9986996242346191, 2.001300375765381, 0, 1, 0.332899874744873, 0, 0.4996751172934538, 9.972309650784267, 0.667100125255127, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.06643987093574, 0, 1, 0.3110941009671125, 0, 0.4839240735067568, 9.657956823261427, 0.6889058990328875, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6659771286858235, 2.334022871314176, 0, 1, 0.2219923762286079, 0, 0.4284448161542428, 8.550724715103641, 0.7780076237713921, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315345829948902, 2.068465417005108, 1, 0, 0.3105115276649635, 1.073497450609931, 0, -21.42441881996426, 1, 0.3105115276649635, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9341791287427939, 2.065101235530429, 0, 1, 0.3114677573562422, 0, 0.4842377617110603, 9.664217282905799, 0.6885322426437579, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.004726505402894884, 2.995273494597105, 0, 1, 0.001575501800964961, 0, 0.333859329307927, 6.663026627572717, 0.998424498199035, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315347897096103, 2.068465210290389, 1, 0, 0.3105115965698702, 1.073497212392607, 0, -21.42441406572128, 1, 0.3105115965698702, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.999883499740989, 2.000116500259011, 0, 1, 0.3332944999136629, 0, 0.4999708766316872, 9.978212293523313, 0.6667055000863371, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.996827261051913, 2, 0, 0.3336862331027352, 2, 0, -39.91517410272658, 0.9999999999999999, 0.111346502162293, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6655742972092707, 2.334425702790729, 1, 0, 0.221858099069757, 1.502461865178635, 0, -29.98551346565626, 1, 0.221858099069757, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 19.95758705136329, 0.4444444444444445, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 1, 0.2213176777627869, 0, 0.4280735850990447, 8.543315839003355, 0.7786823222372131, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.931534941778307, 2, 1, 0, 0.3177635471788802, 1.073497037149238, 0, -21.42441056828648, 1, 0.3177635471788802, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979756295230204, 2.002024370476979, 0, 1, 0.3326585431743401, 0, 0.4994944191222565, 9.968703351302574, 0.6673414568256599, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315348809823325, 2.068465119017667, 1, 0, 0.3105116269941109, 1.073497107210273, 0, -21.42441196653569, 1, 0.3105116269941109, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9995972618498162, 2.000402738150184, 0, 1, 0.3331990872832721, 0, 0.4998993357331243, 9.976784509812513, 0.6668009127167279, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6655752468938446, 2.334424753106155, 1, 0, 0.2218584156312816, 1.502459721371661, 0, -29.98547068044195, 1, 0.2218584156312816, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4406330268776593, 2.032963902638811, 1, 0, 0.1781345301733507, 2.269462203244351, 0, -45.29298948102787, 1, 0.1781345301733507, 0.05010625770672465],
[0.9995974453334956, 2.000116453777929, 0, 1, 0.3332309276660005, 0, 0.4999708882506043, 9.978212525408864, 0.6667690723339994, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -9.978793525681645, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.05010625770672465],
[0.9967501153200848, 2.003249884679915, 0, 1, 0.3322500384400283, 0, 0.4991888469070261, 9.962604867216637, 0.6677499615599718, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3160571844790626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.933156842979307, 0, 0, 0.3409296036771993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6659774824625865, 2.334022517537413, 0, 1, 0.2219924941541955, 0, 0.4284448810952702, 8.550726011169848, 0.7780075058458045, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315354753529211, 2, 1, 0, 0.3177636713540967, 1.073496422260398, 0, -21.42439829658894, 1, 0.3177636713540967, 0.05010625770672465],
[0.9995973673540518, 2.000402632645948, 1, 1, 0.3331991224513506, 1.000402794824294, 0.4998993620985652, -9.988840828129886, 0.8889783447976498, 0.5553765897003511, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -39.91517410272658, 1, 0.1111111111111109, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9967489637665761, 2.003251036233424, 0, 1, 0.3322496545888587, 0, 0.4991885599521425, 9.962599140289566, 0.6677503454111413, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.92753517835338, 1.07246482164662, 1, 0, 0.6425117261177933, 0.5187972760394765, 0, -10.353941798568, 1, 0.6425117261177933, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9807796743495804, 2.01922032565042, 0, 1, 0.3269265581165268, 0, 0.4952406566519112, 9.883808516504837, 0.6730734418834732, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5411021523229871, 2.458897847677012, 0, 0, 0.1803673841076624, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.928758785454766, 1.069216182674577, 1, 0, 0.6433538658457381, 0.5184681503676046, 0, -10.34737324432078, 1, 0.6433538658457381, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315345774226425, 2.020520712340156, 1, 0, 0.3155545834974834, 1.073497457031372, 0, -21.42441894812072, 1, 0.3155545834974833, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979753174960809, 2.001300140999833, 0, 1, 0.3327388001889459, 0, 0.4996751759086013, 9.972310820601175, 0.667261199811054, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979754948779824, 2.002024505122018, 0, 1, 0.3326584982926608, 0, 0.4994943855290387, 9.968702680863007, 0.6673415017073392, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4413828461428131, 2.201211499137365, 0, 1, 0.1670263341519472, 0, 0.454295282571389, 9.06663764894218, 0.8329736658480529, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.004723704841377678, 2.995276295158622, 0, 1, 0.001574568280459227, 0, 0.333859017151886, 6.663020397691356, 0.9984254317195408, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315343216410806, 2.068465678358919, 1, 0, 0.310511440547027, 1.073497751793303, 0, -21.42442483085764, 1, 0.310511440547027, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315050128261677, 2.068494987173831, 1, 0, 0.3105016709420561, 1.073531528258791, 0, -21.42509892760788, 1, 0.3105016709420561, 0.05010625770672465],
[1, 1.999597261047488, 0, 1, 0.3333780881139992, 0, 0.5001007050170444, 9.980803354825818, 0.6666219118860008, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315347642634955, 2.068465235736503, 1, 0, 0.3105115880878319, 1.073497241716616, 0, -21.42441465095774, 1, 0.310511588087832, 0.05010625770672465],
[0.9315354923388169, 2.068464507661182, 1, 0, 0.3105118307796058, 1.073496402685944, 0, -21.42439790593007, 1, 0.3105118307796058, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6659772213022083, 2.331998457573987, 0, 2, 0.2221423028861438, 0, 0.8576335003585851, 17.11629524157187, 0.6050625969592717, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4413835476198463, 2.201211924099868, 0, 1, 0.1670265284048975, 0, 0.4542951948658582, 9.066635898551414, 0.8329734715951025, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315349644889346, 2.068465035511065, 1, 0, 0.3105116548296449, 1.073497010977604, 0, -21.42441004596383, 1, 0.3105116548296449, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979753815879522, 2.002024618412047, 0, 1, 0.3326584605293175, 0, 0.499494357263785, 9.968702116756745, 0.6673415394706825, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9282905012111597, 2.071709498788839, 1, 0, 0.3094301670703867, 1.077248984768539, 0, -21.49929038951084, 1, 0.3094301670703867, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315354682658983, 2.020520062238157, 1, 0, 0.3155548595343805, 1.073496430427445, 0, -21.42439845958349, 1, 0.3155548595343804, 0.05010625770672465],
[1.928759397244162, 1.069215852576136, 1, 0, 0.6433540094634785, 0.5184679859130245, 0, -10.34736996220418, 1, 0.6433540094634785, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3160571844790626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315347451551483, 2.06846525484485, 1, 0, 0.3105115817183829, 1.073497263737005, 0, -21.42441509043158, 1, 0.3105115817183829, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.931534978918561, 2.068465021081438, 1, 0, 0.3105116596395204, 1.073496994348963, 0, -21.42440971409628, 1, 0.3105116596395204, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315354338055972, 2.068464566194402, 1, 0, 0.3105118112685325, 1.073496470139311, 0, -21.4243992521365, 1, 0.3105118112685326, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.33402234824211, 0, 1, 0.2214671399167433, 0, 0.4284449121719675, 8.550726631385739, 0.7785328600832567, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.933156842979307, 0, 0, 0.3409296036771993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3160571844790626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.202446580048186, 1.463392159707973, 1, 0, 0.451057508511626, 0.8316377763409053, 0, -16.59748331652581, 1, 0.451057508511626, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4406329887904222, 2.032963940726048, 1, 0, 0.1781345147758392, 2.269462399411109, 0, -45.29299339604301, 1, 0.1781345147758393, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.665574476934078, 2, 1, 0, 0.2496926957747646, 1.502461459469464, 0, -29.98550536868017, 1, 0.2496926957747646, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6655753396973146, 2.334424660302685, 1, 0, 0.2218584465657716, 1.502459511878509, 0, -29.98546649946413, 1, 0.2218584465657716, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.933156842979307, 0, 0, 0.3409296036771993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6655742971589523, 2.334425702841047, 1, 0, 0.2218580990529841, 1.502461865292223, 0, -29.98551346792321, 1, 0.2218580990529841, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6655746500843819, 2, 1, 0, 0.2496927445131999, 1.502461068601726, 0, -29.98549756790325, 1, 0.2496927445132, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9967505552903645, 2.003249444709636, 0, 1, 0.3322501850967882, 0, 0.4991889565430264, 9.962607055286655, 0.6677498149032118, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9986996242346191, 2.001300375765381, 0, 1, 0.332899874744873, 0, 0.4996751172934538, 9.972309650784267, 0.667100125255127, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.06643987093574, 0, 1, 0.3110941009671125, 0, 0.4839240735067568, 9.657956823261427, 0.6889058990328875, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6659771286858235, 2.334022871314176, 0, 1, 0.2219923762286079, 0, 0.4284448161542428, 8.550724715103641, 0.7780076237713921, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315345829948902, 2.068465417005108, 1, 0, 0.3105115276649635, 1.073497450609931, 0, -21.42441881996426, 1, 0.3105115276649635, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9341791287427939, 2.065101235530429, 0, 1, 0.3114677573562422, 0, 0.4842377617110603, 9.664217282905799, 0.6885322426437579, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.004726505402894884, 2.995273494597105, 0, 1, 0.001575501800964961, 0, 0.333859329307927, 6.663026627572717, 0.998424498199035, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315347897096103, 2.068465210290389, 1, 0, 0.3105115965698702, 1.073497212392607, 0, -21.42441406572128, 1, 0.3105115965698702, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.999883499740989, 2.000116500259011, 0, 1, 0.3332944999136629, 0, 0.4999708766316872, 9.978212293523313, 0.6667055000863371, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.996827261051913, 2, 0, 0.3336862331027352, 2, 0, -39.91517410272658, 0.9999999999999999, 0.111346502162293, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6655742972092707, 2.334425702790729, 1, 0, 0.221858099069757, 1.502461865178635, 0, -29.98551346565626, 1, 0.221858099069757, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 19.95758705136329, 0.4444444444444445, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 1, 0.2213176777627869, 0, 0.4280735850990447, 8.543315839003355, 0.7786823222372131, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.931534941778307, 2, 1, 0, 0.3177635471788802, 1.073497037149238, 0, -21.42441056828648, 1, 0.3177635471788802, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979756295230204, 2.002024370476979, 0, 1, 0.3326585431743401, 0, 0.4994944191222565, 9.968703351302574, 0.6673414568256599, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315348809823325, 2.068465119017667, 1, 0, 0.3105116269941109, 1.073497107210273, 0, -21.42441196653569, 1, 0.3105116269941109, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9995972618498162, 2.000402738150184, 0, 1, 0.3331990872832721, 0, 0.4998993357331243, 9.976784509812513, 0.6668009127167279, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6655752468938446, 2.334424753106155, 1, 0, 0.2218584156312816, 1.502459721371661, 0, -29.98547068044195, 1, 0.2218584156312816, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4406330268776593, 2.032963902638811, 1, 0, 0.1781345301733507, 2.269462203244351, 0, -45.29298948102787, 1, 0.1781345301733507, 0.05010625770672465],
[0.9995974453334956, 2.000116453777929, 0, 1, 0.3332309276660005, 0, 0.4999708882506043, 9.978212525408864, 0.6667690723339994, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -9.978793525681645, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.05010625770672465],
[0.9967501153200848, 2.003249884679915, 0, 1, 0.3322500384400283, 0, 0.4991888469070261, 9.962604867216637, 0.6677499615599718, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3160571844790626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.933156842979307, 0, 0, 0.3409296036771993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6659774824625865, 2.334022517537413, 0, 1, 0.2219924941541955, 0, 0.4284448810952702, 8.550726011169848, 0.7780075058458045, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315354753529211, 2, 1, 0, 0.3177636713540967, 1.073496422260398, 0, -21.42439829658894, 1, 0.3177636713540967, 0.05010625770672465],
[0.9995973673540518, 2.000402632645948, 1, 1, 0.3331991224513506, 1.000402794824294, 0.4998993620985652, -9.988840828129886, 0.8889783447976498, 0.5553765897003511, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -39.91517410272658, 1, 0.1111111111111109, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9967489637665761, 2.003251036233424, 0, 1, 0.3322496545888587, 0, 0.4991885599521425, 9.962599140289566, 0.6677503454111413, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.92753517835338, 1.07246482164662, 1, 0, 0.6425117261177933, 0.5187972760394765, 0, -10.353941798568, 1, 0.6425117261177933, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9807796743495804, 2.01922032565042, 0, 1, 0.3269265581165268, 0, 0.4952406566519112, 9.883808516504837, 0.6730734418834732, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5411021523229871, 2.458897847677012, 0, 0, 0.1803673841076624, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.928758785454766, 1.069216182674577, 1, 0, 0.6433538658457381, 0.5184681503676046, 0, -10.34737324432078, 1, 0.6433538658457381, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315345774226425, 2.020520712340156, 1, 0, 0.3155545834974834, 1.073497457031372, 0, -21.42441894812072, 1, 0.3155545834974833, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979753174960809, 2.001300140999833, 0, 1, 0.3327388001889459, 0, 0.4996751759086013, 9.972310820601175, 0.667261199811054, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979754948779824, 2.002024505122018, 0, 1, 0.3326584982926608, 0, 0.4994943855290387, 9.968702680863007, 0.6673415017073392, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4413828461428131, 2.201211499137365, 0, 1, 0.1670263341519472, 0, 0.454295282571389, 9.06663764894218, 0.8329736658480529, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.004723704841377678, 2.995276295158622, 0, 1, 0.001574568280459227, 0, 0.333859017151886, 6.663020397691356, 0.9984254317195408, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315343216410806, 2.068465678358919, 1, 0, 0.310511440547027, 1.073497751793303, 0, -21.42442483085764, 1, 0.310511440547027, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315050128261677, 2.068494987173831, 1, 0, 0.3105016709420561, 1.073531528258791, 0, -21.42509892760788, 1, 0.3105016709420561, 0.05010625770672465],
[1, 1.999597261047488, 0, 1, 0.3333780881139992, 0, 0.5001007050170444, 9.980803354825818, 0.6666219118860008, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315347642634955, 2.068465235736503, 1, 0, 0.3105115880878319, 1.073497241716616, 0, -21.42441465095774, 1, 0.310511588087832, 0.05010625770672465],
[0.9315354923388169, 2.068464507661182, 1, 0, 0.3105118307796058, 1.073496402685944, 0, -21.42439790593007, 1, 0.3105118307796058, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6659772213022083, 2.331998457573987, 0, 2, 0.2221423028861438, 0, 0.8576335003585851, 17.11629524157187, 0.6050625969592717, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4413835476198463, 2.201211924099868, 0, 1, 0.1670265284048975, 0, 0.4542951948658582, 9.066635898551414, 0.8329734715951025, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.934235406241071, 0, 0, 0.2180474582739845, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315349644889346, 2.068465035511065, 1, 0, 0.3105116548296449, 1.073497010977604, 0, -21.42441004596383, 1, 0.3105116548296449, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9979753815879522, 2.002024618412047, 0, 1, 0.3326584605293175, 0, 0.499494357263785, 9.968702116756745, 0.6673415394706825, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9282905012111597, 2.071709498788839, 1, 0, 0.3094301670703867, 1.077248984768539, 0, -21.49929038951084, 1, 0.3094301670703867, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315354682658983, 2.020520062238157, 1, 0, 0.3155548595343805, 1.073496430427445, 0, -21.42439845958349, 1, 0.3155548595343804, 0.05010625770672465],
[1.928759397244162, 1.069215852576136, 1, 0, 0.6433540094634785, 0.5184679859130245, 0, -10.34736996220418, 1, 0.6433540094634785, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3160571844790626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.7842089125353977, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2614029708451326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315347451551483, 2.06846525484485, 1, 0, 0.3105115817183829, 1.073497263737005, 0, -21.42441509043158, 1, 0.3105115817183829, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.203314556563759, 1.460638476724601, 0, 0, 0.4517026169483168, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.931534978918561, 2.068465021081438, 1, 0, 0.3105116596395204, 1.073496994348963, 0, -21.42440971409628, 1, 0.3105116596395204, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9315354338055972, 2.068464566194402, 1, 0, 0.3105118112685325, 1.073496470139311, 0, -21.4243992521365, 1, 0.3105118112685326, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.033562422077052, 0, 0, 0.1778925669694432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.33402234824211, 0, 1, 0.2214671399167433, 0, 0.4284449121719675, 8.550726631385739, 0.7785328600832567, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.47359692951647, 0, 0, 0.4042695833211097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.933156842979307, 0, 0, 0.3409296036771993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.933156842979307, 1.066843157020694, 0, 0, 0.6443856143264355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 2.200394660719549, 0, 0, 0.1666526459962684, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4606384767246012, 2.539361523275399, 0, 0, 0.1535461589082004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3160571844790626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.202446580048186, 1.463392159707973, 1, 0, 0.451057508511626, 0.8316377763409053, 0, -16.59748331652581, 1, 0.451057508511626, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 9.978793525681645, 0.6666666666666667, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.215791087464602, 0, 0, 0.2305597322010532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4406329887904222, 2.032963940726048, 1, 0, 0.1781345147758392, 2.269462399411109, 0, -45.29299339604301, 1, 0.1781345147758393, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.665574476934078, 2, 1, 0, 0.2496926957747646, 1.502461459469464, 0, -29.98550536868017, 1, 0.2496926957747646, 0.05010625770672465],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -19.95758705136329, 1, 0.3333333333333333, 0.05010625770672465],
[0.6655753396973146, 2.334424660302685, 1, 0, 0.2218584465657716, 1.502459511878509, 0, -29.98546649946413, 1, 0.2218584465657716, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2, 0, 0, 0.2492360131697903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9806631525815682, 2.019336847418432, 0, 0, 0.3268877175271894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 1.933156842979307, 0, 0, 0.3409296036771993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1.103987540727778, 1.775756580025184, 0, 0, 0.3833630678405969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2, 0, 0, 0.3181407926456015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 2.10106764488357, 0, 0, 0.2042704003499048, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.5393615232753985, 1.527481633745295, 0, 0, 0.260959096699372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6655742971589523, 2.334425702841047, 1, 0, 0.2218580990529841, 1.502461865292223, 0, -29.98551346792321, 1, 0.2218580990529841, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6655746500843819, 2, 1, 0, 0.2496927445131999, 1.502461068601726, 0, -29.98549756790325, 1, 0.2496927445132, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0, 2.119930985121163, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9331568429793065, 2.066843157020692, 0, 0, 0.3110522809931022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.6639530332883606, 2.336046966711639, 0, 0, 0.2213176777627869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.9967505552903645, 2.003249444709636, 0, 1, 0.3322501850967882, 0, 0.4991889565430264, 9.962607055286655, 0.6677498149032118, 1, 0.05010625770672465],
[0.6404291681589681, 2, 0, 0, 0.2425473767226657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465],
[0.4400345074394178, 1.626808649581276, 0, 0, 0.2129017414527561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05010625770672465]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0006035779805582303,
"Nucleotide GTR":0.0006326129143673596,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1025":{
"Global MG94xREV":0.0006037577335776652,
"Nucleotide GTR":0.0006328013143507162,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node109":{
"Global MG94xREV":0.0006037906234936397,
"Nucleotide GTR":0.0006328357864260199,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.0006038873658673436,
"Nucleotide GTR":0.0006329371825619668,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node132":{
"Global MG94xREV":0.0006038168076168908,
"Nucleotide GTR":0.0006328632301284972,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node174":{
"Global MG94xREV":0.0006036344187864124,
"Nucleotide GTR":0.0006326720675392148,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node177":{
"Global MG94xREV":0.0006035239094499065,
"Nucleotide GTR":0.0006325562421849384,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node186":{
"Global MG94xREV":0.0006037611523039109,
"Nucleotide GTR":0.00063280489753374,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node189":{
"Global MG94xREV":0.0006037416723239634,
"Nucleotide GTR":0.0006327844804753255,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.0006035908129422634,
"Nucleotide GTR":0.0006326263640492941,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"Global MG94xREV":0.0003313338087850944,
"Nucleotide GTR":0.0003472725201309001,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node256":{
"Global MG94xREV":0.0002721903553531351,
"Nucleotide GTR":0.0002852839889940648,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node265":{
"Global MG94xREV":0.0003188605669359261,
"Nucleotide GTR":0.0003341992568045715,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node266":{
"Global MG94xREV":0.0002847343469794562,
"Nucleotide GTR":0.0002984314054938969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.0006037667779187321,
"Nucleotide GTR":0.0006328107937670378,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node311":{
"Global MG94xREV":0.0006036771657641062,
"Nucleotide GTR":0.000632716870847172,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node350":{
"Global MG94xREV":0.0006039022367825012,
"Nucleotide GTR":0.0006329527688379411,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node353":{
"Global MG94xREV":0.0006038234181039961,
"Nucleotide GTR":0.0006328701586110584,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node356":{
"Global MG94xREV":0.0006037937955813547,
"Nucleotide GTR":0.0006328391111060424,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node359":{
"Global MG94xREV":0.0006035720585310251,
"Nucleotide GTR":0.0006326067074628502,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node362":{
"Global MG94xREV":0.0006040373749191642,
"Nucleotide GTR":0.0006330944077532604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node365":{
"Global MG94xREV":0.0006038946992598555,
"Nucleotide GTR":0.0006329448687250787,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node368":{
"Global MG94xREV":0.0006038967735580186,
"Nucleotide GTR":0.0006329470428067193,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node371":{
"Global MG94xREV":0.0006038825573879998,
"Nucleotide GTR":0.0006329321427721979,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.0006037837718878874,
"Nucleotide GTR":0.0006328286052258718,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node377":{
"Global MG94xREV":0.0006037881915348023,
"Nucleotide GTR":0.0006328332374785477,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node380":{
"Global MG94xREV":0.0006036051841247877,
"Nucleotide GTR":0.0006326414265531514,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node383":{
"Global MG94xREV":0.000603738870333527,
"Nucleotide GTR":0.0006327815436959977,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node387":{
"Global MG94xREV":0.0006037900054330483,
"Nucleotide GTR":0.0006328351386338129,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0006037925927164228,
"Nucleotide GTR":0.0006328378503776612,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node393":{
"Global MG94xREV":0.0006038698666977315,
"Nucleotide GTR":0.0006329188416001635,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node398":{
"Global MG94xREV":0.0006035175105410035,
"Nucleotide GTR":0.0006325495354584832,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node405":{
"Global MG94xREV":0.0006038004466378945,
"Nucleotide GTR":0.0006328460821096188,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node408":{
"Global MG94xREV":0.0006037289611698565,
"Nucleotide GTR":0.000632771157855045,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0006036724979429994,
"Nucleotide GTR":0.0006327119784819604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node418":{
"Global MG94xREV":0.0005620988570517006,
"Nucleotide GTR":0.0005891384503343932,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node419":{
"Global MG94xREV":4.195460266976833e-05,
"Nucleotide GTR":4.397281597565869e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.000603834334262087,
"Nucleotide GTR":0.0006328815998875899,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node428":{
"Global MG94xREV":0.0005921514381417838,
"Nucleotide GTR":0.0006206367016292383,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node429":{
"Global MG94xREV":1.137545495194441e-05,
"Nucleotide GTR":1.192266772679244e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node433":{
"Global MG94xREV":0.0006036329562931084,
"Nucleotide GTR":0.0006326705346931183,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node441":{
"Global MG94xREV":0.000602425169982781,
"Nucleotide GTR":0.000631404648192417,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node442":{
"Global MG94xREV":1.094448410935108e-06,
"Nucleotide GTR":1.147096516387228e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node447":{
"Global MG94xREV":0.0006038272210807507,
"Nucleotide GTR":0.0006328741445288449,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node451":{
"Global MG94xREV":0.0005996921465559926,
"Nucleotide GTR":0.0006285401535111234,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTG", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.0006037043588189753,
"Nucleotide GTR":0.0006327453720156138,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node502":{
"Global MG94xREV":0.000603632803242937,
"Nucleotide GTR":0.0006326703742805161,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node520":{
"Global MG94xREV":0.0006037583970737823,
"Nucleotide GTR":0.0006328020097641092,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node523":{
"Global MG94xREV":0.0006036552690414952,
"Nucleotide GTR":0.0006326939207894297,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAC", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.0006037611402707901,
"Nucleotide GTR":0.0006328048849217692,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.0006037611522254548,
"Nucleotide GTR":0.0006328048974515082,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "F", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node532":{
"Global MG94xREV":0.000603761152698658,
"Nucleotide GTR":0.0006328048979474758,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTT", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node535":{
"Global MG94xREV":0.0006035238907185894,
"Nucleotide GTR":0.0006325562225525569,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAC", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node541":{
"Global MG94xREV":0.0006038774344616743,
"Nucleotide GTR":0.0006329267734090713,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node547":{
"Global MG94xREV":0.0006037611693669203,
"Nucleotide GTR":0.0006328049154175594,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.00060371539598448,
"Nucleotide GTR":0.0006327569401205827,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTT", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.0006036762085877416,
"Nucleotide GTR":0.0006327158676261329,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.0006036717745525406,
"Nucleotide GTR":0.000632711220293026,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node592":{
"Global MG94xREV":0.0006038948698351456,
"Nucleotide GTR":0.0006329450475058413,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"Global MG94xREV":0.0006035625549497397,
"Nucleotide GTR":0.0006325967467146991,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.0006035591893539794,
"Nucleotide GTR":0.0006325932192179856,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node605":{
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node609":{
"Global MG94xREV":0.0006038844496553626,
"Nucleotide GTR":0.0006329341260665027,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node630":{
"Global MG94xREV":0.0006039908345443283,
"Nucleotide GTR":0.0006330456285679545,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node633":{
"Global MG94xREV":0.0006036591718214173,
"Nucleotide GTR":0.0006326980113113837,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node637":{
"Global MG94xREV":0.0006039733160949114,
"Nucleotide GTR":0.0006330272673988955,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node64":{
"Global MG94xREV":0.0006039919895720383,
"Nucleotide GTR":0.0006330468391579175,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node642":{
"Global MG94xREV":0.0006035579025210528,
"Nucleotide GTR":0.0006325918704823563,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node645":{
"Global MG94xREV":0.0006040013224960935,
"Nucleotide GTR":0.0006330566210394248,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node649":{
"Global MG94xREV":0.0006035561912633772,
"Nucleotide GTR":0.0006325900769051532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node652":{
"Global MG94xREV":0.000603911981035103,
"Nucleotide GTR":0.0006329629818348292,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node655":{
"Global MG94xREV":0.0006037106838400519,
"Nucleotide GTR":0.0006327520012998905,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node666":{
"Global MG94xREV":0.000603622836579207,
"Nucleotide GTR":0.00063265992817348,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node676":{
"Global MG94xREV":0.0006037473146185315,
"Nucleotide GTR":0.0006327903941907448,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node681":{
"Global MG94xREV":0.0006037526861218232,
"Nucleotide GTR":0.0006327960240885562,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node685":{
"Global MG94xREV":0.0006034356138433142,
"Nucleotide GTR":0.0006324636991452457,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.0006035582660816125,
"Nucleotide GTR":0.0006325922515318846,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.0006036872155460461,
"Nucleotide GTR":0.0006327274040707918,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.000603727368022601,
"Nucleotide GTR":0.0006327694880699296,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node705":{
"Global MG94xREV":0.0006037802650527606,
"Nucleotide GTR":0.0006328249296955157,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.0006038892892315855,
"Nucleotide GTR":0.0006329391984490574,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node720":{
"Global MG94xREV":0.0006039581116143815,
"Nucleotide GTR":0.0006330113315114887,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node727":{
"Global MG94xREV":0.0006037495529322641,
"Nucleotide GTR":0.0006327927401778738,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node730":{
"Global MG94xREV":0.0006035625143512663,
"Nucleotide GTR":0.0006325967041632486,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node733":{
"Global MG94xREV":0.000510444920753885,
"Nucleotide GTR":0.0005349997172585357,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node734":{
"Global MG94xREV":9.30942425918545e-05,
"Nucleotide GTR":9.757251260622055e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node749":{
"Global MG94xREV":0.0006038552344014358,
"Nucleotide GTR":0.0006329035054217376,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node86":{
"Global MG94xREV":0.000603817748632445,
"Nucleotide GTR":0.0006328642164113156,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node889":{
"Global MG94xREV":0.0006038718285892473,
"Nucleotide GTR":0.000632920897867869,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGT", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node90":{
"Global MG94xREV":0.000603565152532342,
"Nucleotide GTR":0.0006325994692532158,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445039200100882,
"Nucleotide GTR":0.0006324725491924567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCC", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450772704729608,
"Nucleotide GTR":0.0006330351965520393,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "Q", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAA", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451363110636833,
"Nucleotide GTR":0.0006330931349939326,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "Y", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TAT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001291460989657581,
"Nucleotide GTR":0.00126735245349409,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "A", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTA", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GCT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644503919746391,
"Nucleotide GTR":0.0006324725489336823,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAY", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "AS", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "KCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "VF", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "KTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447934147386239,
"Nucleotide GTR":0.0006327566397359749,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "F", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TTT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450494481417947,
"Nucleotide GTR":0.0006330078935982929,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCA", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453798238788168,
"Nucleotide GTR":0.0006333321019981154,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACC", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450559939335111,
"Nucleotide GTR":0.0006330143171954883,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "E", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAG", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445038797192084,
"Nucleotide GTR":0.0006324725096537126,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "S", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TCA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447215686283097,
"Nucleotide GTR":0.0006326861348233912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "T", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "ACT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448249929985302,
"Nucleotide GTR":0.0006327876285041139,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "A", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "GCA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452315203805842,
"Nucleotide GTR":0.0006331865669770408,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448014699270259,
"Nucleotide GTR":0.0006327645445529734,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTG", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "L", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CTC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTT", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "LF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTK", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644590784665312,
"Nucleotide GTR":0.0006325577922890753,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644915719388867,
"Nucleotide GTR":0.0006328766612463415,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447772084523243,
"Nucleotide GTR":0.000632740735982885,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450947324242231,
"Nucleotide GTR":0.0006330523325297812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "N", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "AAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTY", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715635563,
"Nucleotide GTR":0.000632809000514604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "L", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TTA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAT", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001290600416572724,
"Nucleotide GTR":0.001266507945282661,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "L", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCA", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CTA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445076736648523,
"Nucleotide GTR":0.0006324762327753231,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "I", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446216592281537,
"Nucleotide GTR":0.0006325880904965182,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCC", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KQE", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-AG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446468636132092,
"Nucleotide GTR":0.0006326128243750425,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "F", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTT", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448249929772511,
"Nucleotide GTR":0.000632787628483232,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "G", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GGT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447738446912873,
"Nucleotide GTR":0.0006327374350153475,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645135970794135,
"Nucleotide GTR":0.0006330928010764164,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446469042280929,
"Nucleotide GTR":0.0006326128642317427,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCT", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450921774434082,
"Nucleotide GTR":0.0006330498252444437,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "K", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "AAG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502878973337,
"Nucleotide GTR":0.0006327143179712772,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "I", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "ATC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACY", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418737_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006451234996295279,
"Nucleotide GTR":0.0006330805627190913,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449104251039423,
"Nucleotide GTR":0.0006328714657932513,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "I", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "ATT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449372303264821,
"Nucleotide GTR":0.0006328977706253954,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "T", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "ACA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448685252236289,
"Nucleotide GTR":0.0006328303480850581,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAC", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467309489403,
"Nucleotide GTR":0.0006328089606581679,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "Y", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "TAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "S", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "TCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KR", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "ARG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "EV", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GWG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445039200100882,
"Nucleotide GTR":0.0006324725491924567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGC", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447215293518624,
"Nucleotide GTR":0.0006326860962801424,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAA", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445925237434973,
"Nucleotide GTR":0.0006325594989027651,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGC", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACY", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "F", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "TTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":4.059318044615543e-07,
"Nucleotide GTR":3.983540133659305e-07,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715635563,
"Nucleotide GTR":0.000632809000514604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAT", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "AV", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GYC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAR", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420191_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715635563,
"Nucleotide GTR":0.000632809000514604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAT", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420191_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420287_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420287_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445336377121998,
"Nucleotide GTR":0.000632501712135036,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "Y", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "TAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006476356436173734,
"Nucleotide GTR":0.0006355458108930764,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Q", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAG", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "HP", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CMT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAY", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420718_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502485179058,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793269693,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "D", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAT", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAY", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420730_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447411421658524,
"Nucleotide GTR":0.0006327053429690703,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "V", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445476916515958,
"Nucleotide GTR":0.0006325155037204703,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATC", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448905876285054,
"Nucleotide GTR":0.0006328519986367781,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "Y", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "TAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445476913662353,
"Nucleotide GTR":0.0006325155034404364,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "L", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "CTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446019249297157,
"Nucleotide GTR":0.0006325687245909697,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "S", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "TCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445476528233111,
"Nucleotide GTR":0.0006325154656170183,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006444697745692862,
"Nucleotide GTR":0.0006324390411666459,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "R", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AGA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001289811290404001,
"Nucleotide GTR":0.001265733550241651,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "V", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAC", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GTT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446468636109183,
"Nucleotide GTR":0.0006326128243727949,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "L", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449699297563577,
"Nucleotide GTR":0.0006329298596338996,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644469773044152,
"Nucleotide GTR":0.0006324390396699813,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "C", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TGT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "TI", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "AYA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "VL", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "KTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451734414961843,
"Nucleotide GTR":0.0006331295722886765,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAY", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452499201574923,
"Nucleotide GTR":0.0006332046232734328,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "G", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "GG-", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "AV", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GYA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTY", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "F", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "TTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001290215805147918,
"Nucleotide GTR":0.001266130513647658,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "F", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "F", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "TTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "TTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445476528233111,
"Nucleotide GTR":0.0006325154656170183,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAC", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644866930837542,
"Nucleotide GTR":0.0006328287834624069,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAA", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644765490211302,
"Nucleotide GTR":0.0006327292364938339,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTA", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450360800917427,
"Nucleotide GTR":0.0006329947750982626,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "H", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAC", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006445476528233111,
"Nucleotide GTR":0.0006325154656170183,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAC", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447503316682545,
"Nucleotide GTR":0.0006327143609250976,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006451514277458619,
"Nucleotide GTR":0.0006331079694832447,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGA", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445925252394635,
"Nucleotide GTR":0.0006325595003708055,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCC", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448906282432737,
"Nucleotide GTR":0.0006328520384933637,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "I", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ATT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423124_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644765490211302,
"Nucleotide GTR":0.0006327292364938339,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAA", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423136_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "CF", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TKT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423153_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450295485398181,
"Nucleotide GTR":0.0006329883654750351,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423158_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTR", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423178_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447876294795145,
"Nucleotide GTR":0.0006327509624740323,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "TTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "KQ", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "MAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423387_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448906282637576,
"Nucleotide GTR":0.000632852038513466,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "I", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ATA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "GV", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GKT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423454_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423457_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAN", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423461_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "SG", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "RGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423467_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448501683674173,
"Nucleotide GTR":0.0006328123339081342,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "AG", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GST", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "DG", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GRT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423494_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "DA", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GMC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423530_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "RG", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "SGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "GV", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GKG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGK", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAY", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423778_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "KR", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "ARA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423783_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423803_England_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "SRGC", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "NGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAT", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423808_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "SF", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TYT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423845_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Y", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "TAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423845_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449668497044911,
"Nucleotide GTR":0.0006329268370793499,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450623199063813,
"Nucleotide GTR":0.0006330205250773383,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "L", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CTA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000647257505277155,
"Nucleotide GTR":0.0006351747315054107,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "A", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GCT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446086505700118,
"Nucleotide GTR":0.0006325753246793966,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448467309489403,
"Nucleotide GTR":0.0006328089606581679,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "L", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CTT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000644793414720023,
"Nucleotide GTR":0.0006327566397177208,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "I", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATT", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446597767868887,
"Nucleotide GTR":0.0006326254964901711,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAT", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "KR", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "ARA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCK", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450041747140841,
"Nucleotide GTR":0.0006329634653188887,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451049778712932,
"Nucleotide GTR":0.0006330623867184762,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGA", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAC", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782701278,
"Nucleotide GTR":0.000632625497945722,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAT", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644866930837542,
"Nucleotide GTR":0.0006328287834624069,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "R", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CGT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447163549695269,
"Nucleotide GTR":0.0006326810184913427,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "T", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ACG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425279_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450360800917427,
"Nucleotide GTR":0.0006329947750982626,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "T", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425425_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425436_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601341903,
"Nucleotide GTR":0.000632749324291455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425491_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006444624317184412,
"Nucleotide GTR":0.0006324318353895381,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "P", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "CCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446019249297157,
"Nucleotide GTR":0.0006325687245909697,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGT", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447232279662506,
"Nucleotide GTR":0.0006326877631853988,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "D", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAT", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "RI", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AKA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446527095013956,
"Nucleotide GTR":0.0006326185611342602,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTC", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446468636132092,
"Nucleotide GTR":0.0006326128243750425,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "L", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "TTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447934136777553,
"Nucleotide GTR":0.0006327566386949102,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "I", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATT", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449002395450214,
"Nucleotide GTR":0.0006328614703747365,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "G", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "GGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451533381786522,
"Nucleotide GTR":0.0006331098442527525,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACA", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "SL", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TYA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449617883947681,
"Nucleotide GTR":0.0006329218702523635,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAT", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000644785958854409,
"Nucleotide GTR":0.0006327493230355648,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "C", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TGT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001264762041614114,
"Nucleotide GTR":0.001241151911952707,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "I", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTA", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ATC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGN", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725586348126,
"Nucleotide GTR":0.0006326380397310875,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTC", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449382698147944,
"Nucleotide GTR":0.0006328987907089082,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATT", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001290182108665559,
"Nucleotide GTR":0.001266097446199293,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006444544320449891,
"Nucleotide GTR":0.0006324239850511561,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447812893090079,
"Nucleotide GTR":0.0006327447406595824,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "V", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GTT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597380623766,
"Nucleotide GTR":0.0006326254584885554,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCT", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601683295,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412359769,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTC", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446661755145777,
"Nucleotide GTR":0.0006326317757686793,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644641114604437,
"Nucleotide GTR":0.0006326071826867297,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "R", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AGG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597767868887,
"Nucleotide GTR":0.0006326254964901711,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "TTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "AV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GYT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000644793414720023,
"Nucleotide GTR":0.0006327566397177208,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTT", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447934541493129,
"Nucleotide GTR":0.0006327566784109581,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "C", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "TGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447373685083245,
"Nucleotide GTR":0.0006327016397568448,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "TTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAY", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449339117561632,
"Nucleotide GTR":0.0006328945140049713,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "S", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447934136755078,
"Nucleotide GTR":0.0006327566386927042,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "I", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATT", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTC", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAC", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446116723768288,
"Nucleotide GTR":0.0006325782900761944,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTT", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006446597770539642,
"Nucleotide GTR":0.0006326254967522611,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "F", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "TTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAC", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449852403298964,
"Nucleotide GTR":0.000632944884395076,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "Y", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "TAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448369624293984,
"Nucleotide GTR":0.0006327993744938875,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "I", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "ATC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447757151386264,
"Nucleotide GTR":0.0006327392705458382,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445076736648523,
"Nucleotide GTR":0.0006324762327753231,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATC", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "V", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GTA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450582705137049,
"Nucleotide GTR":0.0006330165512772901,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449899146021935,
"Nucleotide GTR":0.0006329494714097154,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "S", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "AGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447215686283097,
"Nucleotide GTR":0.0006326861348233912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "I", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "ATC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450184635349772,
"Nucleotide GTR":0.0006329774874011368,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGT", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601558701,
"Nucleotide GTR":0.0006327493243127307,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "V", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GTA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601341903,
"Nucleotide GTR":0.000632749324291455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTG", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449899560962805,
"Nucleotide GTR":0.0006329495121292043,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "I", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446725588949333,
"Nucleotide GTR":0.0006326380399863522,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAC", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429037_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "KE", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "RAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "IV", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "RTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644884911761654,
"Nucleotide GTR":0.0006328464287249978,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "E", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "GAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006446922305402156,
"Nucleotide GTR":0.0006326573444083304,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "I", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ATC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447683590007073,
"Nucleotide GTR":0.0006327320517296946,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATC", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "T", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ACT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000644659778293354,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979685146,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAT", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449899158015753,
"Nucleotide GTR":0.0006329494725867073,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "Y", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TAC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453084851592476,
"Nucleotide GTR":0.0006332620950044868,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "I", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "ATC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "I", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ATT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450921774434082,
"Nucleotide GTR":0.0006330498252444437,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "N", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446268926457334,
"Nucleotide GTR":0.0006325932262185114,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATT", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "L", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CTC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "AV", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GYT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450128112891253,
"Nucleotide GTR":0.0006329719406694074,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "C", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TGT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447502878995794,
"Nucleotide GTR":0.0006327143179734804,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "F", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TTC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006447573135929754,
"Nucleotide GTR":0.0006327212125137212,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001289826599173184,
"Nucleotide GTR":0.001265748573232157,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "V", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCC", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GTT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449758759763343,
"Nucleotide GTR":0.0006329356948519491,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449899143330356,
"Nucleotide GTR":0.0006329494711455822,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "D", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GAC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447278375967416,
"Nucleotide GTR":0.0006326922867649413,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAC", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006476129458956371,
"Nucleotide GTR":0.0006355235368843673,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "A", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "GCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450921761993849,
"Nucleotide GTR":0.0006330498240236431,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "Y", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TAT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446158909974738,
"Nucleotide GTR":0.0006325824299451239,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "S", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "TCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452389116813246,
"Nucleotide GTR":0.0006331938202995969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "L", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTA", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTY", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "DG", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GRT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "PL", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CYC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446158912640135,
"Nucleotide GTR":0.0006325824302066877,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "I", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ATA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGY", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAY", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "HY", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "YAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446158912640135,
"Nucleotide GTR":0.0006325824302066877,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "I", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ATT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCW", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "DG", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GRT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451090069360622,
"Nucleotide GTR":0.0006330663405700916,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATA", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "TP", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "MCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "TI", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "AYT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "RC", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "YGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449314687899474,
"Nucleotide GTR":0.0006328921166431826,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "S", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "TCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449885644524406,
"Nucleotide GTR":0.0006329481464640795,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449226852835425,
"Nucleotide GTR":0.0006328834971041644,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "I", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "ATT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "HL", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CWT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "NS", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ART", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449344846036191,
"Nucleotide GTR":0.0006328950761587143,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "V", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GTA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445476528233111,
"Nucleotide GTR":0.0006325154656170183,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGC", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "MI", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATK", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446495641525803,
"Nucleotide GTR":0.0006326154745017017,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "F", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "TTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTY", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "VF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "KTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "HY", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "YAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432600_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432733_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447859202430501,
"Nucleotide GTR":0.0006327492851449882,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGG", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432733_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456633145132698,
"Nucleotide GTR":0.0006336103005298507,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "Y", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TAT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432990_England_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006445039200100882,
"Nucleotide GTR":0.0006324725491924567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432990_England_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450808630317316,
"Nucleotide GTR":0.0006330387220461953,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "A", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "GCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451494417077582,
"Nucleotide GTR":0.0006331060205197964,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCC", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006447859215267268,
"Nucleotide GTR":0.0006327492864047015,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAG", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006446158909974738,
"Nucleotide GTR":0.0006325824299451239,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTT", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445663340131049,
"Nucleotide GTR":0.0006325337980729803,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATC", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449382695466807,
"Nucleotide GTR":0.0006328987904457995,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "L", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CTT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448153988042979,
"Nucleotide GTR":0.0006327782134109,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAC", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433677_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433677_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433679_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433679_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433715_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449206684950368,
"Nucleotide GTR":0.0006328815179643513,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAA", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433715_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433746_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447278375990144,
"Nucleotide GTR":0.0006326922867671713,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGC", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433746_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433766_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447654899397434,
"Nucleotide GTR":0.0006327292362273445,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "K", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AAA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433766_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433787_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449382292868126,
"Nucleotide GTR":0.0006328987509374881,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACT", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433787_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433793_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447215686283097,
"Nucleotide GTR":0.0006326861348233912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACA", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433793_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433858_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064489058789994,
"Nucleotide GTR":0.0006328519989031455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGT", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433858_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448937643402166,
"Nucleotide GTR":0.0006328551160467607,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001290707580616086,
"Nucleotide GTR":0.001266613108825632,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449470113830945,
"Nucleotide GTR":0.0006329073690927085,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447238243430236,
"Nucleotide GTR":0.0006326883484292214,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447934147386239,
"Nucleotide GTR":0.0006327566397359749,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "C", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGT", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006449320776644662,
"Nucleotide GTR":0.0006328927141514482,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449210740712893,
"Nucleotide GTR":0.0006328819159694504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "I", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATT", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447934134114537,
"Nucleotide GTR":0.0006327566384335798,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "V", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GTT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450801781040545,
"Nucleotide GTR":0.0006330380499045055,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "CGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450214308370307,
"Nucleotide GTR":0.0006329803993106459,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006472980064164707,
"Nucleotide GTR":0.0006352144765838081,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "-", "I", "T", "R", "C", "N", "-", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTT", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "---", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "---", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KN", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAK", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451049778241611,
"Nucleotide GTR":0.0006330623866722243,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "T", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "ACT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445476525801738,
"Nucleotide GTR":0.0006325154653784203,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "L", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "CTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446158909974738,
"Nucleotide GTR":0.0006325824299451239,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTT", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447215686283097,
"Nucleotide GTR":0.0006326861348233912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "D", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GAT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450921761993849,
"Nucleotide GTR":0.0006330498240236431,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCA", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000644793414720023,
"Nucleotide GTR":0.0006327566397177208,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "F", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "TTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447934133928546,
"Nucleotide GTR":0.0006327566384153281,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "H", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAT", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006448249929985302,
"Nucleotide GTR":0.0006327876285041139,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "V", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "GTC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447163549695269,
"Nucleotide GTR":0.0006326810184913427,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCC", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449879466875184,
"Nucleotide GTR":0.0006329475402313741,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "S", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AGT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01105893155145033,
"Nucleotide GTR":0.01085248733565685,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "F", "Q", "V", "Y", "G", "F", "L", "Y", "L", "F", "F", "T", "R", "V", "E", "A", "F", "S", "L", "F", "R", "A", "C", "F", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TTT", "CAA", "GTT", "TAT", "GGT", "TTC", "CTT", "TAC", "TTG", "TTT", "TTC", "ACC", "CGC", "GTA", "GAA", "GCT", "TTT", "AGT", "CTT", "TTT", "CGT", "GCT", "TGT", "TTT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1.5, 1, 1, 1.5, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0.5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004568469422333716,
"Nucleotide GTR":0.004483186853861134,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "K", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "E", "A", "Q", "P", "C", "S", "E", "K", "A", "K", "K", "I", "Q", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "AAA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAA", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAA", "AAA", "GCA", "AAA", "AAA", "ATA", "CAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAW", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725604500409,
"Nucleotide GTR":0.0006326380415124294,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCC", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "LF", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTK", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCW", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTR", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "AS", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "KCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTY", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601341903,
"Nucleotide GTR":0.000632749324291455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "V", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "GTA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006445039200100882,
"Nucleotide GTR":0.0006324725491924567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTC", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447849371029656,
"Nucleotide GTR":0.0006327483203578149,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001290611228071817,
"Nucleotide GTR":0.00126651855495652,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "V", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GTT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006444860066139976,
"Nucleotide GTR":0.000632454970197298,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712949969,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002510579,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "S", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "TCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435637_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725588949333,
"Nucleotide GTR":0.0006326380399863522,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "T", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ACA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435637_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTY", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "VF", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "KTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502889443346,
"Nucleotide GTR":0.0006327143189987334,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "S", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "TCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447502889443346,
"Nucleotide GTR":0.0006327143189987334,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "F", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006447206770543294,
"Nucleotide GTR":0.0006326852598929978,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450128112868761,
"Nucleotide GTR":0.0006329719406672011,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "C", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TGT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAC", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446394955787041,
"Nucleotide GTR":0.0006326055938843953,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "L", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "CTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGY", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000644641114604437,
"Nucleotide GTR":0.0006326071826867297,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCG", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "IV", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "RTA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502471660741,
"Nucleotide GTR":0.0006327142780003737,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "C", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "TGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450996156312915,
"Nucleotide GTR":0.0006330571245788722,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "E", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAA", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447859603911874,
"Nucleotide GTR":0.0006327493245436548,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAG", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAC", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "KN", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAM", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "LF", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "YTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGY", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452831761221607,
"Nucleotide GTR":0.0006332372584275364,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "N", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTY", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AAT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "TI", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "AYT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445039200100882,
"Nucleotide GTR":0.0006324725491924567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAC", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715430177,
"Nucleotide GTR":0.0006328090004944498,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "M", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ATG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436658_California_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["AV", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GYT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436658_California_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449899143330356,
"Nucleotide GTR":0.0006329494711455822,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "S", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "AGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436671_California_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446904412133904,
"Nucleotide GTR":0.0006326555884840244,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCG", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAT", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAY", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447282219087168,
"Nucleotide GTR":0.0006326926639027167,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGY", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447502878995794,
"Nucleotide GTR":0.0006327143179734804,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "I", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "ATA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTC", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644989915822304,
"Nucleotide GTR":0.0006329494726070491,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "S", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "AGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449756699569871,
"Nucleotide GTR":0.0006329354926784981,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446516778340984,
"Nucleotide GTR":0.0006326175487257621,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000644750248515656,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793247629,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456633145132698,
"Nucleotide GTR":0.0006336103005298507,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "H", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CAT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644659778293354,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979685146,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "I", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ATA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445925252605825,
"Nucleotide GTR":0.0006325595003915304,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAC", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601899294,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412571735,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCC", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447163150296483,
"Nucleotide GTR":0.0006326809792970476,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "T", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ACG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437557_California_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437571_California_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437571_California_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437597_California_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715430177,
"Nucleotide GTR":0.0006328090004944498,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "TTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437597_California_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "TM", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "AYG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451082752699262,
"Nucleotide GTR":0.0006330656225624396,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725586348126,
"Nucleotide GTR":0.0006326380397310875,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "CTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446597380623766,
"Nucleotide GTR":0.0006326254584885554,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAT", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTT", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445924850877052,
"Nucleotide GTR":0.0006325594609685856,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGC", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTC", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "MV", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "RTG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGY", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "TI", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AYT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597380623766,
"Nucleotide GTR":0.0006326254584885554,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "TTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "SF", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TYT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "AV", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GYT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006446411145810146,
"Nucleotide GTR":0.0006326071826637442,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006451494417077582,
"Nucleotide GTR":0.0006331060205197964,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "N", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AAT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438577_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438577_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438597_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438597_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438608_England_20200420_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438608_England_20200420_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438625_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006445039200100882,
"Nucleotide GTR":0.0006324725491924567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "T", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ACC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438625_England_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438717_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455053937789412,
"Nucleotide GTR":0.0006334553278038364,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGG", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438717_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006450922186920864,
"Nucleotide GTR":0.0006330498657231061,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "Y", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TAT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTT", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502878973337,
"Nucleotide GTR":0.0006327143179712772,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "F", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TTC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006445039197698518,
"Nucleotide GTR":0.0006324725489567059,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACC", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439545_England_20200328_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439545_England_20200328_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439709_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439709_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439807_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448249929985302,
"Nucleotide GTR":0.0006327876285041139,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAG", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439807_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440303_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "IL", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "MTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440303_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440403_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCK", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440403_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440995_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440995_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440999_England_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440999_England_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441033_England_20200406_null_44":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441033_England_20200406_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441037_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441037_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441296_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449899158015753,
"Nucleotide GTR":0.0006329494725867073,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAA", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441296_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441354_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "I", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATT", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441354_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "RC", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "YGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "V", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GTT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449899546297532,
"Nucleotide GTR":0.0006329495106900537,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "I", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "ATT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441883_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725588949333,
"Nucleotide GTR":0.0006326380399863522,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAC", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441883_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441884_England_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCC", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441884_England_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441927_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006445228925512182,
"Nucleotide GTR":0.0006324911675609117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTC", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441927_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442005_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446275971785803,
"Nucleotide GTR":0.0006325939175993886,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442005_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442155_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCC", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442155_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442387_England_20200410_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006447859202430501,
"Nucleotide GTR":0.0006327492851449882,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "A", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "GCA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442387_England_20200410_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442392_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447934541493129,
"Nucleotide GTR":0.0006327566784109581,
"amino-acid": [
["S", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442392_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442496_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442496_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442502_England_20200409_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "I", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "ATC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442502_England_20200409_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442516_England_20200408_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006447981252251547,
"Nucleotide GTR":0.000632761262288812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442516_England_20200408_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006446597377952584,
"Nucleotide GTR":0.0006326254582264234,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "I", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ATA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442641_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "S", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TCG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442641_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442700_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "L", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "TTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442700_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442736_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442736_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597380623766,
"Nucleotide GTR":0.0006326254584885554,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "S", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "TCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "HY", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "YAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449371895346135,
"Nucleotide GTR":0.000632897730595015,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAA", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597380623766,
"Nucleotide GTR":0.0006326254584885554,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGT", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601341903,
"Nucleotide GTR":0.000632749324291455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTG", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006448240151114132,
"Nucleotide GTR":0.0006327866688718476,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444054_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448095931033149,
"Nucleotide GTR":0.0006327725160886857,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCT", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444054_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444057_California_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444057_California_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444065_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450056606127051,
"Nucleotide GTR":0.0006329649234792816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444065_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444069_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTR", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444069_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449968363100516,
"Nucleotide GTR":0.0006329562639055831,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTT", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444125_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444151_England_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAT", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444151_England_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444173_England_20200411_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444173_England_20200411_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444184_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCC", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444184_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444198_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064537982494789,
"Nucleotide GTR":0.0006333321030472311,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "L", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "CTC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444198_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444212_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597380623766,
"Nucleotide GTR":0.0006326254584885554,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "L", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CTG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444212_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444220_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446725601922011,
"Nucleotide GTR":0.0006326380412594033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "T", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ACC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444220_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444234_England_20200416_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444234_England_20200416_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444242_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "L", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CTA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444242_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444248_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444248_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444261_England_20200418_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000644803886340572,
"Nucleotide GTR":0.000632766915857768,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444261_England_20200418_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444265_England_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGT", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444265_England_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452470381792728,
"Nucleotide GTR":0.0006332017950949613,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "M", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATG", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444282_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444320_England_20200420_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006449962013984771,
"Nucleotide GTR":0.0006329556408463126,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444320_England_20200420_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444328_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456603466916062,
"Nucleotide GTR":0.0006336073881104303,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444328_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444342_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444348_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448291473877835,
"Nucleotide GTR":0.0006327917053407,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444348_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444427_England_20200419_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "S", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "TCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444427_England_20200419_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444451_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449098319695906,
"Nucleotide GTR":0.0006328708837313217,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444451_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006446411546453659,
"Nucleotide GTR":0.0006326072219801881,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "R", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AGA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644751932637821,
"Nucleotide GTR":0.0006327159320083308,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447215683550315,
"Nucleotide GTR":0.0006326861345552147,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "I", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "ATT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446597377952584,
"Nucleotide GTR":0.0006326254582264234,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "L", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CTA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006448485440508702,
"Nucleotide GTR":0.0006328107399137533,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAT", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447934538644707,
"Nucleotide GTR":0.0006327566781314339,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "C", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGT", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715635563,
"Nucleotide GTR":0.000632809000514604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCT", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006447934541470679,
"Nucleotide GTR":0.0006327566784087553,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "Y", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "TAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006448467324053124,
"Nucleotide GTR":0.0006328089620873521,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "S", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "TCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447934133928546,
"Nucleotide GTR":0.0006327566384153281,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCT", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000645706687212632,
"Nucleotide GTR":0.0006336528635630293,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "N", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "AAT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450101450798842,
"Nucleotide GTR":0.000632969324232016,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445174_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449101032187514,
"Nucleotide GTR":0.0006328711499169002,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445182_California_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445220_Bucharest_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "F", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445220_Bucharest_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445241_Skane_20200423_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006448467715635563,
"Nucleotide GTR":0.000632809000514604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "L", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CTT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445241_Skane_20200423_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445264_Santiago_20200312_null_57":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445264_Santiago_20200312_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445278_Rancagua_20200316_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006448467712927216,
"Nucleotide GTR":0.0006328090002488258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTT", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445278_Rancagua_20200316_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601341903,
"Nucleotide GTR":0.000632749324291455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "V", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "GTT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGM", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":3.624730975709362e-05,
"Nucleotide GTR":3.557065782172248e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTG", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445307_Santiago_20200316_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445307_Santiago_20200316_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445322_Santiago_20200316_null_1182":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445322_Santiago_20200316_null_1182",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGY", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445354_Santiago_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000644894848933933,
"Nucleotide GTR":0.0006328561803936652,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGT", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445354_Santiago_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445358_Santiago_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006447502484970025,
"Nucleotide GTR":0.0006327142793064576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "F", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "TTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445358_Santiago_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445361_Santiago_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAC", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445361_Santiago_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006446597782724019,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979479536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAT", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_9":{
"Global MG94xREV":0.000644866930837542,
"Nucleotide GTR":0.0006328287834624069,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAT", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAY", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "PS", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "YCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447859601341903,
"Nucleotide GTR":0.000632749324291455,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "V", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "GTA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445697_Wales_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000644659778293354,
"Nucleotide GTR":0.0006326254979685146,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445697_Wales_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445735_Wales_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445735_Wales_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCY", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445805_Wales_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006448467309489403,
"Nucleotide GTR":0.0006328089606581679,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTT", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445805_Wales_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTY", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0006446845148086618,
"Nucleotide GTR":0.0006326497727113194,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "L", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "TTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446061_Wales_20200411_null_47":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446061_Wales_20200411_null_47",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446317_Wales_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006447934147386239,
"Nucleotide GTR":0.0006327566397359749,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "L", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "TTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446317_Wales_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447034_Gujarat_20200503_null_464":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447034_Gujarat_20200503_null_464",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645062280691642,
"Nucleotide GTR":0.0006330204865946457,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCT", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447052_Gujarat_20200502_null_13729":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447052_Gujarat_20200502_null_13729",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447053_Gujarat_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006447273830715469,
"Nucleotide GTR":0.0006326918407246632,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "L", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "TTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447053_Gujarat_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":12916.17207945172,
"Equilibrium frequencies": [
[0.0296030779575979],
[0.015605980570535],
[0.01206615340035842],
[0.04278548225058925],
[0.01704275421823054],
[0.008984501259601147],
[0.006946591400270112],
[0.02463198114566687],
[0.01621178509404742],
[0.008546435730560849],
[0.006607890102461933],
[0.02343097715667458],
[0.02360192161878463],
[0.01244232544796942],
[0.009620094478128364],
[0.0341119798402966],
[0.01766986783991229],
[0.009315099415965204],
[0.007202201616528866],
[0.02553835171861876],
[0.01017269944346954],
[0.005362785251319851],
[0.004146371271138055],
[0.01470265531518609],
[0.009676699850981388],
[0.005101307035627195],
[0.00394420286222971],
[0.01398578452928004],
[0.01408782006956325],
[0.00742673605095073],
[0.005742166347684458],
[0.02036119948064695],
[0.03054945072744783],
[0.01610488393051385],
[0.0124518929856572],
[0.04415327972775877],
[0.01758758940524996],
[0.009271724343462486],
[0.007168665096589989],
[0.0254194342698692],
[0.01673005525452334],
[0.00881965441634279],
[0.006819135948859665],
[0.02418003571010656],
[0.02435644504935977],
[0.01284009077542743],
[0.009927636669197978],
[0.0352024964714647],
[0.01543169661485578],
[0.04230766395147161],
[0.01685242470914285],
[0.008884164442427052],
[0.006869013485684456],
[0.02435689691812475],
[0.008450991127169974],
[0.006534094725071484],
[0.02316930546191386],
[0.02333834085609169],
[0.0123033724557419],
[0.009512659503947911],
[0.03373102519564956]
],
"Log Likelihood":-5835.662347270736,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5704330733383257, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5032109124329568, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":621
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":13985.62462298926,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2934816586413518],
[0.1825588536712138],
[0.1997785478920064],
[0.324180939795428]
],
"Log Likelihood":-5954.49117564816,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2050586699131051,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.4108335178026127,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1226152885285938,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.646489559036926,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.082991795781424
},
"display order":0,
"estimated parameters":1037
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-16/sequences.exonuclease.compressed.fas",
"number of sequences":516,
"number of sites":527,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(((epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1,epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4)Node1025,epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_433746_England_20200327_null_1,epi_isl_433787_England_20200406_null_2,epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1,epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1,epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1,epi_isl_441883_England_20200430_null_1,epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_445358_Santiago_20200313_null_6,epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2,epi_isl_441884_England_20200430_null_2,epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_436940_LA_20200408_null_2,epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2,(epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_442736_England_20200405_null_3)Node547,(epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1)Node535,(epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2)Node532,(epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1,epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1)Node177,(epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1)Node174,epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1,epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1,epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_9,(epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1,epi_isl_445220_Bucharest_20200430_null_3)Node529,(epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2)Node186,(epi_isl_421893_England_20200327_null_1,epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2,epi_isl_444198_England_20200415_null_1)Node189,(epi_isl_420730_England_20200327_null_1,epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4)Node526,(epi_isl_423494_England_20200331_null_1,epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5)Node502,epi_isl_420718_England_20200327_null_1,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2,epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1,epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1,epi_isl_440403_England_20200314_null_1,epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1,epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1,epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1,epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1,epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2,epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1,epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1,epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3,epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4,epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_436658_California_20200409_null_1,epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1,epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_423783_England_20200324_null_1,epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1,epi_isl_423454_England_20200331_null_1,epi_isl_423387_England_20200328_null_2,epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1,epi_isl_423153_England_20200324_null_1,epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1,epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,(epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1,epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2)Node245,epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4,epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1,((epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6)Node266,epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1)Node265,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2,((epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1,epi_isl_423457_England_20200328_null_2,epi_isl_423461_England_20200330_null_1)Node256,epi_isl_423178_England_20200324_null_2)Node255,epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1,epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1,epi_isl_423467_England_20200330_null_1,(epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1,epi_isl_420287_England_20200320_null_2,epi_isl_423363_England_20200329_null_1)Node276,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1,(epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1)Node451,(epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1,epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1,epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3)Node433,((epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9,epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1)Node429,epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1)Node428,(epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1,epi_isl_445307_Santiago_20200316_null_9)Node423,((epi_isl_442496_England_20200420_null_1,epi_isl_444065_California_20200430_null_1)Node419,epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1)Node418,(epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5,epi_isl_444125_England_20200408_null_1)Node408,(epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1)Node405,(epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1,epi_isl_425436_England_20200401_null_1,epi_isl_423803_England_20200324_null_6,epi_isl_423804_England_20200324_null_1)Node398,(epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3,epi_isl_438597_England_20200421_null_1)Node393,(epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_444173_England_20200411_null_15)Node390,(epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6,epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2)Node387,epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2,(epi_isl_429037_California_20200325_null_1,epi_isl_445174_California_20200331_null_1)Node383,(epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2,epi_isl_432600_England_20200329_null_1)Node380,(epi_isl_424181_USA_20200316_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5)Node377,(epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1,epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2)Node374,(epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5,epi_isl_441037_England_20200404_null_2)Node371,(epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1,epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2)Node368,(epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1,epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3)Node365,(epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1,epi_isl_441033_England_20200406_null_44)Node362,(epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1,epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1)Node359,((epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1)Node353,(epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10,epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1)Node350,epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1,epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1,epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1,epi_isl_445322_Santiago_20200316_null_1182,epi_isl_444054_California_20200429_null_1,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1,epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1,epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1,epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2,epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1,epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1,epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4,epi_isl_444069_California_20200430_null_1,epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1)Node311,(epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1,epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5)Node356,(epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3)Node414,epi_isl_444261_England_20200418_null_6,((epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4)Node442,epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1)Node441,(epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4,epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2)Node447,epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4,(epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1,epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1)Node455,epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2,epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1,epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1,(epi_isl_423778_England_20200324_null_1,epi_isl_445361_Santiago_20200318_null_1)Node523,(epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1,epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3)Node520,epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1,epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_447052_Gujarat_20200502_null_13729,epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1,epi_isl_445354_Santiago_20200402_null_3,epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_441927_England_20200411_null_1,(epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1,epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2)Node541,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,(epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1,epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1)Node551,epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1,epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1,epi_isl_437557_California_20200330_null_1,(epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1,epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4)Node699,epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1,(epi_isl_433677_England_20200402_null_1,epi_isl_433679_England_20200402_null_1)Node599,(epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3,epi_isl_444348_England_20200426_null_2,epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85,epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1,epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1,epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1)Node570,epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1,epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2,(epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1,(epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_445264_Santiago_20200312_null_57,epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1,epi_isl_440303_England_20200318_null_1)Node132,epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4)Node130,epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_444242_England_20200418_null_1,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2,epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1,epi_isl_418309_England_20200325_null_1,epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1,epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2,epi_isl_425279_England_20200330_null_1,(epi_isl_423124_England_20200324_null_1,epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1)Node109,epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1,epi_isl_444212_England_20200416_null_1,epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1,epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3,epi_isl_445697_Wales_20200406_null_3,epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4,(epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4)Node586,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3,(epi_isl_438608_England_20200420_null_20,epi_isl_438717_England_20200425_null_1)Node592,(epi_isl_444234_England_20200416_null_28,epi_isl_444320_England_20200420_null_6)Node595,(epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1,epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2,epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7,epi_isl_444451_England_20200415_null_1)Node666,(epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196,epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1)Node655,(epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13,epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1)Node633,(epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1,epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1,epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3,epi_isl_447034_Gujarat_20200503_null_464,epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1,epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1,epi_isl_447053_Gujarat_20200429_null_1,epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1,epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1)Node609,(epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1,epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2)Node630,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2,(epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1,epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_444057_California_20200428_null_5)Node64,epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1,(epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1)Node637,epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1,(epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1)Node642,(epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1,epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1)Node645,(epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1,epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1)Node649,(epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1,epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3)Node652,(epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1,epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6,epi_isl_444328_England_20200427_null_1)Node676,(epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2,epi_isl_438577_England_20200420_null_3)Node681,(epi_isl_437571_California_20200425_null_2,epi_isl_444342_England_20200427_null_1)Node685,epi_isl_433715_England_20200404_null_1,(epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4,epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1)Node695,(epi_isl_423158_England_20200324_null_2,epi_isl_446061_Wales_20200411_null_47)Node691,epi_isl_423530_England_20200325_null_1,(epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1,epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2,epi_isl_439545_England_20200328_null_9)Node709,(epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1,epi_isl_445735_Wales_20200413_null_7)Node705,epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2,epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2,epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9,epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1,((epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1,epi_isl_440995_England_20200402_null_3)Node734,epi_isl_418737_England_20200317_null_1)Node733,(epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7,epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9)Node730,(epi_isl_445182_California_20200412_null_1,epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1,epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1,epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174)Node720,(epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1,epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7)Node727,epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2,epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1,epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2,epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7,epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17,(epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_439709_England_20200408_null_4)Node749,epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3,epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1,epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2,epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_435637_California_20200311_null_1,epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1,epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1,epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1,epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1,epi_isl_445805_Wales_20200328_null_5,epi_isl_446317_Wales_20200409_null_3,epi_isl_444220_England_20200415_null_1,epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1,epi_isl_432990_England_20200401_null_6,epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2,epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4,epi_isl_444184_England_20200414_null_1,epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1,epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1,epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1,epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1,epi_isl_444427_England_20200419_null_16,epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1,epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1,epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1,epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1,epi_isl_445278_Rancagua_20200316_null_7,epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2,epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7,epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1,epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1,epi_isl_437597_California_20200326_null_3,epi_isl_436671_California_20200418_null_2,epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2,epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5,epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2,epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1,epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1,epi_isl_432733_England_20200401_null_1,epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2,epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1,epi_isl_438625_England_20200421_null_5,epi_isl_444151_England_20200409_null_11,epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3,epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1,(epi_isl_442005_England_20200411_null_1,epi_isl_444248_England_20200418_null_3)Node90,epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1,epi_isl_439807_England_20200412_null_1,epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2,(epi_isl_423469_England_20200331_null_1,epi_isl_440999_England_20200402_null_4)Node86,epi_isl_442516_England_20200408_null_12,epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1,epi_isl_442392_England_20200408_null_2,epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1,epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1,epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1,epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3,epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2,epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2,epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4,epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1,epi_isl_444282_England_20200416_null_1,epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7,epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1,(epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3,epi_isl_444265_England_20200418_null_5)Node889,epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3,epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1,epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1,epi_isl_425425_England_20200330_null_1,epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1,epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1,epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1,epi_isl_423808_England_20200323_null_1,epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_442700_England_20200406_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3,epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_423845_England_20200324_null_1,epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1,epi_isl_433858_England_20200408_null_1,epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3,epi_isl_423055_England_20200319_null_1,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1,epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1,epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1,epi_isl_425491_England_20200318_null_2,epi_isl_423136_England_20200323_null_1,epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1,epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9,epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1,epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1,epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_423399_England_20200329_null_2,epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1,epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1,epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1,epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1,epi_isl_433766_England_20200101_null_1,epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2,epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1,epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1,epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3,epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1,epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1,epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3,epi_isl_442641_England_20200405_null_1,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1,epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2,epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_433793_England_20200406_null_1,epi_isl_441296_England_20200401_null_1,epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_441354_England_20200420_null_3,epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1,epi_isl_420191_England_20200327_null_1,epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1,epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2,epi_isl_442502_England_20200409_null_14,epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1,epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1,epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8,epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1,epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_445241_Skane_20200423_null_9,epi_isl_442387_England_20200410_null_5,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2,epi_isl_442155_England_20200404_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1)Node1,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node1025":"test",
"Node109":"test",
"Node130":"test",
"Node132":"test",
"Node174":"test",
"Node177":"test",
"Node186":"test",
"Node189":"test",
"Node245":"test",
"Node255":"test",
"Node256":"test",
"Node265":"test",
"Node266":"test",
"Node276":"test",
"Node311":"test",
"Node350":"test",
"Node353":"test",
"Node356":"test",
"Node359":"test",
"Node362":"test",
"Node365":"test",
"Node368":"test",
"Node371":"test",
"Node374":"test",
"Node377":"test",
"Node380":"test",
"Node383":"test",
"Node387":"test",
"Node390":"test",
"Node393":"test",
"Node398":"test",
"Node405":"test",
"Node408":"test",
"Node414":"test",
"Node418":"test",
"Node419":"test",
"Node423":"test",
"Node428":"test",
"Node429":"test",
"Node433":"test",
"Node441":"test",
"Node442":"test",
"Node447":"test",
"Node451":"test",
"Node455":"test",
"Node502":"test",
"Node520":"test",
"Node523":"test",
"Node526":"test",
"Node529":"test",
"Node532":"test",
"Node535":"test",
"Node541":"test",
"Node547":"test",
"Node551":"test",
"Node570":"test",
"Node586":"test",
"Node592":"test",
"Node595":"test",
"Node599":"test",
"Node609":"test",
"Node630":"test",
"Node633":"test",
"Node637":"test",
"Node64":"test",
"Node642":"test",
"Node645":"test",
"Node649":"test",
"Node652":"test",
"Node655":"test",
"Node666":"test",
"Node676":"test",
"Node681":"test",
"Node685":"test",
"Node691":"test",
"Node695":"test",
"Node699":"test",
"Node705":"test",
"Node709":"test",
"Node720":"test",
"Node727":"test",
"Node730":"test",
"Node733":"test",
"Node734":"test",
"Node749":"test",
"Node86":"test",
"Node889":"test",
"Node90":"test",
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":"background",
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":"background",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"background",
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":"background",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":"background",
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418309_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_420191_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420287_England_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":"background",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423845_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":"background",
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":"background",
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":"background",
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13":"background",
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":"background",
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":"background",
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_432733_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_432990_England_20200401_null_6":"background",
"epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433677_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433679_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433715_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433746_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_433766_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_433787_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_433793_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_433858_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2":"background",
"epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6":"background",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5":"background",
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2":"background",
"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2":"background",
"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5":"background",
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3":"background",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5":"background",
"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4":"background",
"epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_435637_California_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7":"background",
"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7":"background",
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_436658_California_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7":"background",
"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8":"background",
"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_437571_California_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_437597_California_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4":"background",
"epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5":"background",
"epi_isl_438577_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_438597_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438608_England_20200420_null_20":"background",
"epi_isl_438625_England_20200421_null_5":"background",
"epi_isl_438717_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4":"background",
"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7":"background",
"epi_isl_439545_England_20200328_null_9":"background",
"epi_isl_439709_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_439807_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_440303_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440403_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440995_England_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_440999_England_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_441033_England_20200406_null_44":"background",
"epi_isl_441037_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_441296_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441354_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_441883_England_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_441884_England_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_441927_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442005_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442155_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442387_England_20200410_null_5":"background",
"epi_isl_442392_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_442496_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_442502_England_20200409_null_14":"background",
"epi_isl_442516_England_20200408_null_12":"background",
"epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9":"background",
"epi_isl_442641_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442700_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442736_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85":"background",
"epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_444054_California_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_444057_California_20200428_null_5":"background",
"epi_isl_444065_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444069_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444151_England_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_444173_England_20200411_null_15":"background",
"epi_isl_444184_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_444198_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444212_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444220_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444234_England_20200416_null_28":"background",
"epi_isl_444242_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444248_England_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_444261_England_20200418_null_6":"background",
"epi_isl_444265_England_20200418_null_5":"background",
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444320_England_20200420_null_6":"background",
"epi_isl_444328_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444348_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_444427_England_20200419_null_16":"background",
"epi_isl_444451_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174":"background",
"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9":"background",
"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196":"background",
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445220_Bucharest_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_445241_Skane_20200423_null_9":"background",
"epi_isl_445264_Santiago_20200312_null_57":"background",
"epi_isl_445278_Rancagua_20200316_null_7":"background",
"epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_445307_Santiago_20200316_null_9":"background",
"epi_isl_445322_Santiago_20200316_null_1182":"background",
"epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_445354_Santiago_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_445358_Santiago_20200313_null_6":"background",
"epi_isl_445361_Santiago_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_9":"background",
"epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445697_Wales_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_445735_Wales_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_445805_Wales_20200328_null_5":"background",
"epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17":"background",
"epi_isl_446061_Wales_20200411_null_47":"background",
"epi_isl_446317_Wales_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_447034_Gujarat_20200503_null_464":"background",
"epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_447052_Gujarat_20200502_null_13729":"background",
"epi_isl_447053_Gujarat_20200429_null_1":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":37
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":10
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":48
}
}
}