{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[100.184120870499, 254.0709490891831, 0, 1, 0.2828022218056075, 0, 0.003935908468027894, 0.01579226321193792, 0.7171977781943926, 1, 0.002676318212583715],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 1, 0, 0.2816627155997079, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816627155997079, 0.002675301787105578],
[99.78044501980858, 254.3783007905641, 0, 1, 0.281739322267744, 0, 0.003931152920245838, 0.01577318226457818, 0.718260677732256, 1, 0.00267631955310715],
[99.68368205837615, 254.571387901306, 1, 0, 0.2813895707116377, 0.01003173216870527, 0, -0.04025087376059772, 1, 0.2813895707116377, 0.002674727376791483],
[99.76093485042412, 254.3658128564134, 0, 1, 0.2817096858580443, 0, 0.003931345917796305, 0.01577395663932317, 0.7182903141419557, 1, 0.002676244174460902],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002676244174582126],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002676244168249491],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002676244174582126],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002676244174460902],
[99.57530878703888, 254.6797611726433, 0, 1, 0.2810836519527344, 0, 0.003926499677067453, 0.01575451179963746, 0.7189163480472656, 1, 0.002676244174582126],
[99.5557986176544, 254.6068254590577, 0, 1, 0.2811019341106149, 0, 0.003927624478240101, 0.01575902490158681, 0.7188980658893851, 1, 0.002676179377443179],
[99.65212276696394, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587315, 1, 0.2813004843609024, 0.002676244174582126],
[99.78044501980858, 254.378300790564, 0, 1, 0.281739322267744, 0, 0.003931152920245838, 0.01577318226457818, 0.718260677732256, 1, 0.00267617962657389],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002675076583984652],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.00267728876321892],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002675239963526632],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 1, 0, 0.2816627155997079, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816627155997079, 0.002675426844735682],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002675909985989643],
[98.44400748689723, 247.2179804341843, 0, 0, 0.2847984763351332, 0, 0, 0, 1, 1, 8.587761858692919e-05],
[100.184120870499, 254.0709490891831, 0, 1, 0.2828022218056075, 0, 0.003935908468027894, 0.01579226321193792, 0.7171977781943925, 1, 0.002590379844377096],
[99.57530878703888, 254.6797611726433, 0, 1, 0.2810836519527344, 0, 0.003926499677067453, 0.01575451179963746, 0.7189163480472656, 1, 0.002675177782880631],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002675839384345156],
[97.86130218767052, 247.8006857334111, 0, 1, 0.2831127101253995, 0, 0.004035501342703385, 0.01619186521073565, 0.7168872898746005, 1, 0.003999778321456342],
[100.0050914219628, 254.2499785377194, 0, 1, 0.2822968530368369, 0, 0.003933137008511662, 0.01578114313165223, 0.7177031469631632, 1, 0.002675739888779557],
[97.59984113437291, 248.0621467867086, 0, 0, 0.282356303397341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001595199973580559],
[99.76203769423687, 254.4930322654453, 1, 0, 0.2816107549444269, 0.01002385299170537, 0, -0.04021925970298266, 1, 0.2816107549444269, 0.002516991286970913],
[97.18736298120797, 248.4746249398736, 0, 0, 0.2811630042566234, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004868746718097842],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002190233799006662],
[99.37676916911812, 254.878300790564, 1, 0, 0.2805232093938083, 0.01006271393567055, 0, -0.0403751836175624, 1, 0.2805232093938084, 0.002676744877610679],
[100.4789846377293, 254.1797611726433, 0, 1, 0.2833117350825263, 0, 0.003934223540798682, 0.01578550268523542, 0.7166882649174737, 1, 0.002676939143909143],
[99.65212276696394, 254.571387901306, 1, 0, 0.28132554662722, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587315, 1, 0.28132554662722, 0.002676191062777455],
[100.0937161126106, 254.4261987567697, 0, 1, 0.2823359476138012, 0, 0.003930412846186472, 0.01577021282450182, 0.7176640523861988, 1, 0.002674913338876382],
[97.59763544674739, 247.8077079686449, 0, 0, 0.282559715150018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005084765071345976],
[97.61714561613185, 247.9165200521051, 0, 1, 0.2825112436652081, 0, 0.004033615830803966, 0.01618429986706805, 0.7174887563347918, 1, 0.00125235971318798],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 0, 0.2816627155997079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009121594746330126],
[100.0753087870389, 254.5834370233338, 0, 1, 0.2821735258730845, 0, 0.003927985306869533, 0.01576047267425142, 0.7178264741269156, 1, 0.002679832003418414],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002676179605261256],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.001886645657410511],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002675936709604667],
[99.78044501980858, 254.3783007905641, 0, 1, 0.281739322267744, 0, 0.003931152920245838, 0.01577318226457818, 0.718260677732256, 1, 0.0026771125866629],
[97.43811616759558, 248.223871753486, 0, 1, 0.2818884331297712, 0, 0.00402862139300249, 0.01616426040807217, 0.7181115668702288, 1, 0.001812093633415156],
[96.82930408413543, 248.8326838369461, 0, 0, 0.2801271400031485, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008663166069761164],
[99.37676916911813, 254.8783007905641, 1, 0, 0.2805232093938083, 0.01006271393567055, 0, -0.0403751836175624, 1, 0.2805232093938083, 0.002676666518465492],
[99.78044501980858, 254.7394698495717, 0, 1, 0.281452298826631, 0, 0.00392557934029822, 0.01575081908152132, 0.718547701173369, 1, 0.002676610128959085],
[99.78044501980858, 254.5100624976253, 1, 0, 0.2816345425650407, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816345425650406, 0.002674386691454736],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 1, 0, 0.2816627155997079, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816627155997079, 0.001976534953292228],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.00267628581420665],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002674840778880453],
[97.33992496320101, 246.206037144947, 9.583333333333334, 18.41666666666667, 0.2833388707754873, 0.09845223670509584, 0.07480184840400303, -0.09489376090662377, 0.8131815180958407, 0.3106682406189617, 0.1012526131331313],
[99.90876727265322, 254.346302687029, 2, 0, 0.2820249468385135, 0.02001826320749165, 0, -0.08032038452788537, 1, 0.07953807063926632, 0.005411538886590746],
[99.78044501980858, 254.2499785377194, 0, 1, 0.2818414418092935, 0, 0.003933137008511662, 0.01578114313165223, 0.7181585581907064, 1, 0.002676154291039898],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002676355741778096],
[99.78044501980858, 254.5670708228436, 0, 1, 0.281589232487003, 0, 0.003928237838333428, 0.01576148592020963, 0.7184107675129969, 1, 0.002677148091372408],
[99.64824450062446, 254.6068254590577, 0, 1, 0.2812895366944655, 0, 0.003927624478240101, 0.01575902490158681, 0.7187104633055346, 1, 0.002674686231163515],
[99.86906971045642, 254.6508451589239, 0, 1, 0.2817022839104886, 0, 0.003926945537431516, 0.01575630074983339, 0.7182977160895114, 1, 0.002677055442131926],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.001881661900983928],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.00267542738456629],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002674775711608672],
[97.2263833199769, 248.4356046011047, 0, 0, 0.2812758900818876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009790101514857263],
[99.57530878703886, 254.6797611726433, 0, 1, 0.2810836519527344, 0, 0.003926499677067453, 0.01575451179963746, 0.7189163480472656, 1, 0.001696004487722983],
[96.60121822776462, 246.0607696933169, 0, 1, 0.281914019158766, 0, 0.004064036706242817, 0.01630635922794252, 0.7180859808412341, 1, 0.003016575865793508],
[97.76885630470046, 247.8931316163811, 0, 1, 0.2828452642210175, 0, 0.004033996397881315, 0.01618582683739882, 0.7171547357789825, 1, 0.002175423597750044],
[99.91264553899272, 254.3424244206894, 0, 1, 0.2820358945049504, 0, 0.003931707430554221, 0.01577540715695432, 0.7179641054950496, 1, 0.001854424849039476]
],
"NAMES": [
["Node438"],
["Node433"],
["Node430"],
["Node427"],
["Node424"],
["Node421"],
["Node418"],
["Node415"],
["Node412"],
["Node409"],
["Node406"],
["Node403"],
["Node385"],
["Node382"],
["Node379"],
["Node376"],
["Node340"],
["Node345"],
["Node360"],
["Node359"],
["Node364"],
["Node335"],
["Node303"],
["Node301"],
["Node313"],
["Node312"],
["Node322"],
["Node321"],
["Node327"],
["Node332"],
["Node373"],
["Node369"],
["Node287"],
["Node286"],
["Node285"],
["Node278"],
["Node400"],
["Node391"],
["Node396"],
["Node267"],
["Node248"],
["Node247"],
["Node246"],
["Node161"],
["Node156"],
["Node141"],
["Node228"],
["Node219"],
["Node208"],
["Node206"],
["Node449"],
["Node460"],
["Node469"],
["Node497"],
["Node494"],
["Node483"],
["Node490"],
["Node104"],
["Node83"],
["Node82"],
["Node92"],
["Node91"],
["Node90"]
],
"RESOLVED": [
[100.184120870499, 254.0709490891831, 0, 1, 0.2828022218056075, 0, 0.003935908468027894, 0.01579226321193792, 0.7171977781943926, 1, 0.002676318212583715],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 1, 0, 0.2816627155997079, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816627155997079, 0.002675301787105578],
[99.78044501980858, 254.3783007905641, 0, 1, 0.281739322267744, 0, 0.003931152920245838, 0.01577318226457818, 0.718260677732256, 1, 0.00267631955310715],
[99.68368205837615, 254.571387901306, 1, 0, 0.2813895707116377, 0.01003173216870527, 0, -0.04025087376059772, 1, 0.2813895707116377, 0.002674727376791483],
[99.76093485042412, 254.3658128564134, 0, 1, 0.2817096858580443, 0, 0.003931345917796305, 0.01577395663932317, 0.7182903141419557, 1, 0.002676244174460902],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002676244174582126],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002676244168249491],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002676244174582126],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002676244174460902],
[99.57530878703888, 254.6797611726433, 0, 1, 0.2810836519527344, 0, 0.003926499677067453, 0.01575451179963746, 0.7189163480472656, 1, 0.002676244174582126],
[99.5557986176544, 254.6068254590577, 0, 1, 0.2811019341106149, 0, 0.003927624478240101, 0.01575902490158681, 0.7188980658893851, 1, 0.002676179377443179],
[99.65212276696394, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587315, 1, 0.2813004843609024, 0.002676244174582126],
[99.78044501980858, 254.378300790564, 0, 1, 0.281739322267744, 0, 0.003931152920245838, 0.01577318226457818, 0.718260677732256, 1, 0.00267617962657389],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002675076583984652],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.00267728876321892],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002675239963526632],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 1, 0, 0.2816627155997079, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816627155997079, 0.002675426844735682],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002675909985989643],
[98.44400748689723, 247.2179804341843, 0, 0, 0.2847984763351332, 0, 0, 0, 1, 1, 8.587761858692919e-05],
[100.184120870499, 254.0709490891831, 0, 1, 0.2828022218056075, 0, 0.003935908468027894, 0.01579226321193792, 0.7171977781943925, 1, 0.002590379844377096],
[99.57530878703888, 254.6797611726433, 0, 1, 0.2810836519527344, 0, 0.003926499677067453, 0.01575451179963746, 0.7189163480472656, 1, 0.002675177782880631],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.002675839384345156],
[97.86130218767052, 247.8006857334111, 0, 1, 0.2831127101253995, 0, 0.004035501342703385, 0.01619186521073565, 0.7168872898746005, 1, 0.003999778321456342],
[100.0050914219628, 254.2499785377194, 0, 1, 0.2822968530368369, 0, 0.003933137008511662, 0.01578114313165223, 0.7177031469631632, 1, 0.002675739888779557],
[97.59984113437291, 248.0621467867086, 0, 0, 0.282356303397341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001595199973580559],
[99.76203769423687, 254.4930322654453, 1, 0, 0.2816107549444269, 0.01002385299170537, 0, -0.04021925970298266, 1, 0.2816107549444269, 0.002516991286970913],
[97.18736298120797, 248.4746249398736, 0, 0, 0.2811630042566234, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004868746718097842],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002190233799006662],
[99.37676916911812, 254.878300790564, 1, 0, 0.2805232093938083, 0.01006271393567055, 0, -0.0403751836175624, 1, 0.2805232093938084, 0.002676744877610679],
[100.4789846377293, 254.1797611726433, 0, 1, 0.2833117350825263, 0, 0.003934223540798682, 0.01578550268523542, 0.7166882649174737, 1, 0.002676939143909143],
[99.65212276696394, 254.571387901306, 1, 0, 0.28132554662722, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587315, 1, 0.28132554662722, 0.002676191062777455],
[100.0937161126106, 254.4261987567697, 0, 1, 0.2823359476138012, 0, 0.003930412846186472, 0.01577021282450182, 0.7176640523861988, 1, 0.002674913338876382],
[97.59763544674739, 247.8077079686449, 0, 0, 0.282559715150018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005084765071345976],
[97.61714561613185, 247.9165200521051, 0, 1, 0.2825112436652081, 0, 0.004033615830803966, 0.01618429986706805, 0.7174887563347918, 1, 0.00125235971318798],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 0, 0.2816627155997079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009121594746330126],
[100.0753087870389, 254.5834370233338, 0, 1, 0.2821735258730845, 0, 0.003927985306869533, 0.01576047267425142, 0.7178264741269156, 1, 0.002679832003418414],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002676179605261256],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.001886645657410511],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002675936709604667],
[99.78044501980858, 254.3783007905641, 0, 1, 0.281739322267744, 0, 0.003931152920245838, 0.01577318226457818, 0.718260677732256, 1, 0.0026771125866629],
[97.43811616759558, 248.223871753486, 0, 1, 0.2818884331297712, 0, 0.00402862139300249, 0.01616426040807217, 0.7181115668702288, 1, 0.001812093633415156],
[96.82930408413543, 248.8326838369461, 0, 0, 0.2801271400031485, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008663166069761164],
[99.37676916911813, 254.8783007905641, 1, 0, 0.2805232093938083, 0.01006271393567055, 0, -0.0403751836175624, 1, 0.2805232093938083, 0.002676666518465492],
[99.78044501980858, 254.7394698495717, 0, 1, 0.281452298826631, 0, 0.00392557934029822, 0.01575081908152132, 0.718547701173369, 1, 0.002676610128959085],
[99.78044501980858, 254.5100624976253, 1, 0, 0.2816345425650407, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816345425650406, 0.002674386691454736],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 1, 0, 0.2816627155997079, 0.01002200380847648, 0, -0.0402118401228489, 1, 0.2816627155997079, 0.001976534953292228],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.00267628581420665],
[99.65212276696396, 254.6029471927182, 1, 0, 0.2813004843609024, 0.01003490916433858, 0, -0.04026362099587314, 1, 0.2813004843609024, 0.002674840778880453],
[97.33992496320101, 246.206037144947, 9.583333333333334, 18.41666666666667, 0.2833388707754873, 0.09845223670509584, 0.07480184840400303, -0.09489376090662377, 0.8131815180958407, 0.3106682406189617, 0.1012526131331313],
[99.90876727265322, 254.346302687029, 2, 0, 0.2820249468385135, 0.02001826320749165, 0, -0.08032038452788537, 1, 0.07953807063926632, 0.005411538886590746],
[99.78044501980858, 254.2499785377194, 0, 1, 0.2818414418092935, 0, 0.003933137008511662, 0.01578114313165223, 0.7181585581907064, 1, 0.002676154291039898],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002676355741778096],
[99.78044501980858, 254.5670708228436, 0, 1, 0.281589232487003, 0, 0.003928237838333428, 0.01576148592020963, 0.7184107675129969, 1, 0.002677148091372408],
[99.64824450062446, 254.6068254590577, 0, 1, 0.2812895366944655, 0, 0.003927624478240101, 0.01575902490158681, 0.7187104633055346, 1, 0.002674686231163515],
[99.86906971045642, 254.6508451589239, 0, 1, 0.2817022839104886, 0, 0.003926945537431516, 0.01575630074983339, 0.7182977160895114, 1, 0.002677055442131926],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.001881661900983928],
[99.78044501980858, 254.4746249398736, 0, 1, 0.2816627155997079, 0, 0.003929664893842663, 0.01576721177394911, 0.7183372844002921, 1, 0.00267542738456629],
[99.5557986176544, 254.6992713420278, 0, 1, 0.2810285781625789, 0, 0.003926198904028786, 0.0157533049913409, 0.718971421837421, 1, 0.002674775711608672],
[97.2263833199769, 248.4356046011047, 0, 0, 0.2812758900818876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009790101514857263],
[99.57530878703886, 254.6797611726433, 0, 1, 0.2810836519527344, 0, 0.003926499677067453, 0.01575451179963746, 0.7189163480472656, 1, 0.001696004487722983],
[96.60121822776462, 246.0607696933169, 0, 1, 0.281914019158766, 0, 0.004064036706242817, 0.01630635922794252, 0.7180859808412341, 1, 0.003016575865793508],
[97.76885630470046, 247.8931316163811, 0, 1, 0.2828452642210175, 0, 0.004033996397881315, 0.01618582683739882, 0.7171547357789825, 1, 0.002175423597750044],
[99.91264553899272, 254.3424244206894, 0, 1, 0.2820358945049504, 0, 0.003931707430554221, 0.01577540715695432, 0.7179641054950496, 1, 0.001854424849039476]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.182809573061211, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.7355989616317257, 2.264401038368273, 0, 0, 0.245199653877242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.7355989616317257, 2.264401038368273, 0, 0, 0.245199653877242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.6124074363133428, 2.723707151099388, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1192722085813045],
[0.9975867958334842, 2.002413204166516, 0, 1, 0.3325289319444947, 0, 0.4993974260253841, 2.003759910379416, 0.6674710680555053, 1, 0.2492301714584269],
[0.805973929881428, 2.194026070118571, 1, 0, 0.2686579766271427, 1.240734920727667, 0, -4.97826933820743, 1, 0.2686579766271426, 0.2492301714584269],
[0.9241650100876373, 1.890943223972274, 0, 0, 0.3282875588605056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1.794339935271471, 1.205660064728529, 1, 0, 0.598113311757157, 0.557307999639827, 0, -2.23611770749349, 1, 0.598113311757157, 0.2492301714584269],
[0.5941540631345693, 2.40584593686543, 0, 1, 0.1980513543781898, 0, 0.4156542132132106, 1.667752386402159, 0.8019486456218102, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.006177651261629, 0.6666666666666667, 1, 0.2492301714584269],
[0.9985812515942781, 2.001418748405722, 0, 1, 0.3328604171980927, 0, 0.499645564326093, 2.004755529406025, 0.6671395828019073, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2.264401038368273, 0, 0, 0.1956255852008272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.3744097585728135, 2.098745200023506, 0, 1, 0.1513895266737819, 0, 0.4764751814507068, 1.911787720814475, 0.8486104733262181, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2, 0, 0, 0.2159037292174612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.8073517013809089, 2.19264829861909, 0, 0, 0.2691172337936363, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.8073517013809089, 2, 0, 0, 0.2875848084811677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 1.782375833079669, 0, 0, 0.1871127557473798, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.3734578143960003, 2.096852366207834, 0, 0, 0.1511785108316695, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2.265394061474987, 0, 1, 0.1955566030483302, 0, 0.4414243053806299, 1.771151152356617, 0.8044433969516698, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5930820386006336, 2, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9342131504980682, 2.065786849501932, 1, 2, 0.3114043834993561, 1.070419528420102, 0.968154096092831, -0.4103252496631598, 0.7694773713426029, 0.6734928010754486, 0.2492301714584269],
[0.9364150343597134, 2.063584965640287, 1, 1, 0.3121383447865711, 1.067902546741749, 0.4845935673357269, -2.340442876529182, 0.9025696537138996, 0.5268463432870418, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9297731016598109, 1.712199269174801, 0, 1, 0.35192385504247, 0, 0.5840441693927089, 2.343392719970627, 0.6480761449575301, 1, 0.2492301714584269],
[0.6909985411861089, 3.676381812972142, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6909985411861089, 3.469604166651289, 0, 0, 0.1660813564064801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.5937385408009446, 4.012355302523257, 0.4444444444444445, 1, 0.1479775583252956],
[1.359776477187759, 3.487856982822494, 0, 0, 0.2805031544577388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 2.481150176635286, 0, 1, 0.4043419066257637, 0, 0.403038884714391, 2.723648702382289, 0.5956580933742363, 1, 0.1479775583252956],
[1.680533045854232, 3.372196049267409, 0, 1, 0.3325990794710861, 0, 0.2965426640059212, 2.003970516624138, 0.6674009205289139, 1, 0.1479775583252956],
[1.359776477187759, 3.368486063414427, 0, 0, 0.2875848084811677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6346565601033501, 3.530733611385309, 0, 1, 0.1523642525608908, 0, 0.283227258146967, 1.913987913791327, 0.8476357474391092, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.683890181060475, 3.042692051043487, 1, 1, 0.3562595758142387, 0.5938629557007236, 0.3286563290744627, -1.792208424221079, 0.8730791146406588, 0.585598266269136, 0.1479775583252956],
[1.691778006884436, 3.360951088237205, 0, 1, 0.3348246017222317, 0, 0.297534826823229, 2.010675336115258, 0.6651753982777683, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.121141638220463, 0, 1, 0.1837167846462271, 0, 0.242651208763552, 1.63978383958828, 0.8162832153537729, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[3.044019508894972, 2.008709586226668, 0, 0, 0.6024505671269696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.2968692704004723, 2.006177651261629, 0.6666666666666667, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.35745570852041, 3.69527338660123, 1, 0, 0.268657923859607, 0.7366722860445832, 0, -4.978270315997332, 1, 0.268657923859607, 0.1479775583252956],
[0.6909985411861089, 3.676381812972142, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6814866029178679, 2.280956197769776, 1, 1, 0.2300421134746233, 1.46738027676315, 0.438412627554075, -4.128583803428924, 0.9470806260281286, 0.4071648529773751, 0.2492301714584269],
[1, 1.998965331560753, 0, 2, 0.3334483361565135, 0, 1.000517601992847, 4.014432105623853, 0.4442911205725202, 1, 0.2492301714584269],
[1.807351701380909, 1.192648298619091, 0, 0, 0.6024505671269696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9265380445500468, 2.073461955449953, 1, 1, 0.3088460148500156, 1.079286496525492, 0.4822851933075349, -2.395381344579864, 0.904614139111264, 0.5223061688112951, 0.2492301714584269],
[0.8459354954008876, 2.05417134330125, 0.75, 2.25, 0.2916911487921123, 0.8865924223271611, 1.095332191901789, 0.837538121300241, 0.6846287613094162, 0.6446404373885455, 0.2492301714584269],
[0.6593498327307367, 2.340650167269263, 1, 1, 0.2197832775769123, 1.516645565614903, 0.427231721332649, -4.37111541474815, 0.95169531089755, 0.3912618660513745, 0.2492301714584269],
[0.8494628158062568, 2.150537184193743, 2, 2, 0.2831542719354189, 2.354429131899936, 0.9300001946954565, -5.715314999259961, 0.9284756426531956, 0.3187245982855207, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.256670563218616, 1.078515979942789, 0, 1, 0.1922357325523076, 0, 0.9271999846057412, 3.802826612656687, 0.8077642674476924, 1, 0.2438186325718362],
[0.3403839011139215, 1.480365687599693, 0, 2, 0.186947125087315, 0, 1.351017533541227, 5.541075836946863, 0.6610549774037824, 1, 0.2438186325718362],
[0.6069165295712053, 1.213833059142411, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.823836517277354, 3.378890729504143, 0.6666666666666667, 1, 0.2438186325718362],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.5937385408009446, 0, -4.012355302523257, 1, 0.3333333333333333, 0.1479775583252956],
[0.5507071956916371, 2.264401038368273, 0, 0, 0.1956255852008272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.357455764507738, 3.695273330613901, 1, 0, 0.2686579349402184, 0.7366722556610421, 0, -4.978270110672002, 1, 0.2686579349402185, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.5937385408009446, 0, -4.012355302523257, 1, 0.3333333333333333, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6909985411861089, 3.676381812972142, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.35745567240613, 3.693531396905335, 1, 1, 0.2687505736559278, 0.7366723056433002, 0.2707436034895657, -3.148644344634301, 0.9277731291596096, 0.4652742764714654, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 3.368486063414427, 0, 0, 0.2159037292174612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6289937215330693, 3.063958896400811, 0, 0, 0.170322716429808, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.618523298040769, 2.677487522228318, 0, 0, 0.3767502843345703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.680180293576745, 3.370876914480844, 0, 1, 0.3326393316029907, 0, 0.2966587108844382, 2.004754736068156, 0.6673606683970092, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.5937385408009446, 0, -4.012355302523257, 1, 0.3333333333333333, 0.1479775583252956],
[0.9988942907438256, 3.368486063414427, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.683943833124671, 3.042350819070029, 0, 1, 0.3562926048935007, 0, 0.3286931913741872, 2.221236754370744, 0.6437073951064993, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.044019508894972, 0, 0, 0.3562075957594162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.5937385408009446, 4.012355302523257, 0.4444444444444445, 1, 0.1479775583252956],
[0.4027942785927065, 2.165349022918748, 1, 1, 0.1568426023406272, 2.48265691234202, 0.4618193138453337, -8.108318453866547, 0.97540039809102, 0.2890856027722742, 0.2492301714584269],
[1.639018261808978, 1.360981738191022, 2, 0, 0.5463394206029927, 1.220242657816764, 0, -4.896047098456168, 1, 0.2984867625048138, 0.2492301714584269],
[0.7538413858871883, 2.17227090086596, 2, 1, 0.2576255837138978, 2.653078004793038, 0.4603477400545932, -8.798012904726527, 0.9829011474843249, 0.1649151191204299, 0.2492301714584269],
[0.9081495243722209, 2.091850475627779, 1, 2, 0.3027165081240736, 1.101140256271425, 0.9560912805681226, -0.5819880267887123, 0.7805683845564904, 0.6609777902142178, 0.2492301714584269],
[0.69024783196404, 2.013044263151535, 0.5, 1.5, 0.2553360153759225, 0.7243775015957581, 0.7451400982369186, 0.08330691472731207, 0.7446639846240775, 0.4454755500037917, 0.2492301714584269],
[0.4134429699588839, 1.783545828276915, 0, 1, 0.1881861984416499, 0, 0.5606808550392568, 2.249650801740036, 0.81181380155835, 1, 0.2492301714584269],
[0.3734578143960003, 2.096852366207834, 0, 0, 0.1511785108316695, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4984855069086356, 2.081296917482372, 1.333333333333333, 2.666666666666667, 0.1932277319961623, 2.674768503505784, 1.281252398092427, -5.591281734706842, 0.8781162676651524, 0.4410647219363849, 0.2492301714584269],
[0.9971481084119626, 2.002851891588038, 0, 1, 0.3323827028039875, 0, 0.4992880423160555, 2.003321024073282, 0.6676172971960126, 1, 0.2492301714584269],
[1.136945479087853, 3.834024317345556, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1220064587046763],
[1.917012158672778, 3.834024317345556, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1220064587046763],
[0.4102724655394217, 1.782375833079669, 0, 0, 0.1871127557473798, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.060037715064414, 0, 0, 0.1660813564064801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9975880386097585, 2.002411961390242, 0, 1, 0.3325293462032529, 0, 0.4993977359712317, 2.003761153992281, 0.6674706537967472, 1, 0.2492301714584269],
[0.8073517013809089, 2, 0, 0, 0.2875848084811677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1.004334808361528, 1.994630829696156, 0, 2, 0.3348937365657839, 0, 1.002691811549239, 4.023155806866241, 0.4423663416594248, 1, 0.2492301714584269],
[0.7355989616317257, 2.264401038368273, 0, 0, 0.245199653877242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2.449292804308363, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9975876368227937, 2.002412363177207, 0, 1, 0.3325292122742645, 0, 0.4993976357663466, 2.00376075193468, 0.6674707877257355, 1, 0.2492301714584269],
[0.7364149323943427, 2.25337090727892, 0, 1, 0.2463102616322584, 0, 0.4437795823003501, 1.796280323058651, 0.7536897383677416, 1, 0.2470547478606769],
[1.007844400065903, 2.028911196535487, 0, 1, 0.3318819602057671, 0, 0.4928751941965585, 2.001819570565197, 0.6681180397942329, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4939482129147098, 2.006177651261629, 0.6666666666666667, 1, 0.2462135955926334],
[0.5969527969143669, 2.439802799687023, 0, 0, 0.1965758448201928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[0.5574543862017453, 2.479301210399644, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[0.5969527969143669, 2.439802799687023, 0, 0, 0.1965758448201928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.009811388034023, 2.026944208567367, 0, 1, 0.3325296870002187, 0, 0.4933534903295609, 2.003762177072572, 0.6674703129997812, 1, 0.2462135955926334],
[0.8158484815296219, 2.097298953112517, 1, 0, 0.2800573949082819, 1.225717792751315, 0, -4.978270147109569, 1, 0.2800573949082819, 0.2462135955926334],
[0.8172432658647099, 2.21951233073668, 0, 0, 0.2691172337936364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[0.9995710788913281, 2.000428921108672, 1, 1, 0.3331903596304426, 1.000429105160933, 0.4998927927145658, -2.008329527349621, 0.8889841842493362, 0.5553649035102216, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.182809573061211, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5930820386006336, 2, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.3734578143960003, 2.219624224204633, 0, 0, 0.1440208249629998, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9969924472802635, 2.003007552719736, 0, 1, 0.3323308157600878, 0, 0.4992492407940118, 2.003165338580565, 0.6676691842399122, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.060037715064414, 0, 0, 0.1660813564064801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.182809573061211, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.7355989616317257, 2.264401038368273, 0, 0, 0.245199653877242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.7355989616317257, 2.264401038368273, 0, 0, 0.245199653877242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.6124074363133428, 2.723707151099388, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1192722085813045],
[0.9975867958334842, 2.002413204166516, 0, 1, 0.3325289319444947, 0, 0.4993974260253841, 2.003759910379416, 0.6674710680555053, 1, 0.2492301714584269],
[0.805973929881428, 2.194026070118571, 1, 0, 0.2686579766271427, 1.240734920727667, 0, -4.97826933820743, 1, 0.2686579766271426, 0.2492301714584269],
[0.9241650100876373, 1.890943223972274, 0, 0, 0.3282875588605056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1.794339935271471, 1.205660064728529, 1, 0, 0.598113311757157, 0.557307999639827, 0, -2.23611770749349, 1, 0.598113311757157, 0.2492301714584269],
[0.5941540631345693, 2.40584593686543, 0, 1, 0.1980513543781898, 0, 0.4156542132132106, 1.667752386402159, 0.8019486456218102, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.006177651261629, 0.6666666666666667, 1, 0.2492301714584269],
[0.9985812515942781, 2.001418748405722, 0, 1, 0.3328604171980927, 0, 0.499645564326093, 2.004755529406025, 0.6671395828019073, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2.264401038368273, 0, 0, 0.1956255852008272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.3744097585728135, 2.098745200023506, 0, 1, 0.1513895266737819, 0, 0.4764751814507068, 1.911787720814475, 0.8486104733262181, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2, 0, 0, 0.2159037292174612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.8073517013809089, 2.19264829861909, 0, 0, 0.2691172337936363, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.8073517013809089, 2, 0, 0, 0.2875848084811677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 1.782375833079669, 0, 0, 0.1871127557473798, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.3734578143960003, 2.096852366207834, 0, 0, 0.1511785108316695, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2.265394061474987, 0, 1, 0.1955566030483302, 0, 0.4414243053806299, 1.771151152356617, 0.8044433969516698, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5930820386006336, 2, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9342131504980682, 2.065786849501932, 1, 2, 0.3114043834993561, 1.070419528420102, 0.968154096092831, -0.4103252496631598, 0.7694773713426029, 0.6734928010754486, 0.2492301714584269],
[0.9364150343597134, 2.063584965640287, 1, 1, 0.3121383447865711, 1.067902546741749, 0.4845935673357269, -2.340442876529182, 0.9025696537138996, 0.5268463432870418, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9297731016598109, 1.712199269174801, 0, 1, 0.35192385504247, 0, 0.5840441693927089, 2.343392719970627, 0.6480761449575301, 1, 0.2492301714584269],
[0.6909985411861089, 3.676381812972142, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6909985411861089, 3.469604166651289, 0, 0, 0.1660813564064801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.5937385408009446, 4.012355302523257, 0.4444444444444445, 1, 0.1479775583252956],
[1.359776477187759, 3.487856982822494, 0, 0, 0.2805031544577388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 2.481150176635286, 0, 1, 0.4043419066257637, 0, 0.403038884714391, 2.723648702382289, 0.5956580933742363, 1, 0.1479775583252956],
[1.680533045854232, 3.372196049267409, 0, 1, 0.3325990794710861, 0, 0.2965426640059212, 2.003970516624138, 0.6674009205289139, 1, 0.1479775583252956],
[1.359776477187759, 3.368486063414427, 0, 0, 0.2875848084811677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6346565601033501, 3.530733611385309, 0, 1, 0.1523642525608908, 0, 0.283227258146967, 1.913987913791327, 0.8476357474391092, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.683890181060475, 3.042692051043487, 1, 1, 0.3562595758142387, 0.5938629557007236, 0.3286563290744627, -1.792208424221079, 0.8730791146406588, 0.585598266269136, 0.1479775583252956],
[1.691778006884436, 3.360951088237205, 0, 1, 0.3348246017222317, 0, 0.297534826823229, 2.010675336115258, 0.6651753982777683, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.121141638220463, 0, 1, 0.1837167846462271, 0, 0.242651208763552, 1.63978383958828, 0.8162832153537729, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[3.044019508894972, 2.008709586226668, 0, 0, 0.6024505671269696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.2968692704004723, 2.006177651261629, 0.6666666666666667, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.35745570852041, 3.69527338660123, 1, 0, 0.268657923859607, 0.7366722860445832, 0, -4.978270315997332, 1, 0.268657923859607, 0.1479775583252956],
[0.6909985411861089, 3.676381812972142, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6814866029178679, 2.280956197769776, 1, 1, 0.2300421134746233, 1.46738027676315, 0.438412627554075, -4.128583803428924, 0.9470806260281286, 0.4071648529773751, 0.2492301714584269],
[1, 1.998965331560753, 0, 2, 0.3334483361565135, 0, 1.000517601992847, 4.014432105623853, 0.4442911205725202, 1, 0.2492301714584269],
[1.807351701380909, 1.192648298619091, 0, 0, 0.6024505671269696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9265380445500468, 2.073461955449953, 1, 1, 0.3088460148500156, 1.079286496525492, 0.4822851933075349, -2.395381344579864, 0.904614139111264, 0.5223061688112951, 0.2492301714584269],
[0.8459354954008876, 2.05417134330125, 0.75, 2.25, 0.2916911487921123, 0.8865924223271611, 1.095332191901789, 0.837538121300241, 0.6846287613094162, 0.6446404373885455, 0.2492301714584269],
[0.6593498327307367, 2.340650167269263, 1, 1, 0.2197832775769123, 1.516645565614903, 0.427231721332649, -4.37111541474815, 0.95169531089755, 0.3912618660513745, 0.2492301714584269],
[0.8494628158062568, 2.150537184193743, 2, 2, 0.2831542719354189, 2.354429131899936, 0.9300001946954565, -5.715314999259961, 0.9284756426531956, 0.3187245982855207, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.256670563218616, 1.078515979942789, 0, 1, 0.1922357325523076, 0, 0.9271999846057412, 3.802826612656687, 0.8077642674476924, 1, 0.2438186325718362],
[0.3403839011139215, 1.480365687599693, 0, 2, 0.186947125087315, 0, 1.351017533541227, 5.541075836946863, 0.6610549774037824, 1, 0.2438186325718362],
[0.6069165295712053, 1.213833059142411, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.823836517277354, 3.378890729504143, 0.6666666666666667, 1, 0.2438186325718362],
[0.9275247568546604, 4.125204338266979, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.5937385408009446, 0, -4.012355302523257, 1, 0.3333333333333333, 0.1479775583252956],
[0.5507071956916371, 2.264401038368273, 0, 0, 0.1956255852008272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.357455764507738, 3.695273330613901, 1, 0, 0.2686579349402184, 0.7366722556610421, 0, -4.978270110672002, 1, 0.2686579349402185, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.5937385408009446, 0, -4.012355302523257, 1, 0.3333333333333333, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6909985411861089, 3.676381812972142, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.35745567240613, 3.693531396905335, 1, 1, 0.2687505736559278, 0.7366723056433002, 0.2707436034895657, -3.148644344634301, 0.9277731291596096, 0.4652742764714654, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.9275247568546604, 3.368486063414427, 0, 0, 0.2159037292174612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[0.6289937215330693, 3.063958896400811, 0, 0, 0.170322716429808, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.618523298040769, 2.677487522228318, 0, 0, 0.3767502843345703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.680180293576745, 3.370876914480844, 0, 1, 0.3326393316029907, 0, 0.2966587108844382, 2.004754736068156, 0.6673606683970092, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.5937385408009446, 0, -4.012355302523257, 1, 0.3333333333333333, 0.1479775583252956],
[0.9988942907438256, 3.368486063414427, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.683943833124671, 3.042350819070029, 0, 1, 0.3562926048935007, 0, 0.3286931913741872, 2.221236754370744, 0.6437073951064993, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.044019508894972, 0, 0, 0.3562075957594162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1479775583252956],
[1.684243031707213, 3.368486063414427, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.5937385408009446, 4.012355302523257, 0.4444444444444445, 1, 0.1479775583252956],
[0.4027942785927065, 2.165349022918748, 1, 1, 0.1568426023406272, 2.48265691234202, 0.4618193138453337, -8.108318453866547, 0.97540039809102, 0.2890856027722742, 0.2492301714584269],
[1.639018261808978, 1.360981738191022, 2, 0, 0.5463394206029927, 1.220242657816764, 0, -4.896047098456168, 1, 0.2984867625048138, 0.2492301714584269],
[0.7538413858871883, 2.17227090086596, 2, 1, 0.2576255837138978, 2.653078004793038, 0.4603477400545932, -8.798012904726527, 0.9829011474843249, 0.1649151191204299, 0.2492301714584269],
[0.9081495243722209, 2.091850475627779, 1, 2, 0.3027165081240736, 1.101140256271425, 0.9560912805681226, -0.5819880267887123, 0.7805683845564904, 0.6609777902142178, 0.2492301714584269],
[0.69024783196404, 2.013044263151535, 0.5, 1.5, 0.2553360153759225, 0.7243775015957581, 0.7451400982369186, 0.08330691472731207, 0.7446639846240775, 0.4454755500037917, 0.2492301714584269],
[0.4134429699588839, 1.783545828276915, 0, 1, 0.1881861984416499, 0, 0.5606808550392568, 2.249650801740036, 0.81181380155835, 1, 0.2492301714584269],
[0.3734578143960003, 2.096852366207834, 0, 0, 0.1511785108316695, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4984855069086356, 2.081296917482372, 1.333333333333333, 2.666666666666667, 0.1932277319961623, 2.674768503505784, 1.281252398092427, -5.591281734706842, 0.8781162676651524, 0.4410647219363849, 0.2492301714584269],
[0.9971481084119626, 2.002851891588038, 0, 1, 0.3323827028039875, 0, 0.4992880423160555, 2.003321024073282, 0.6676172971960126, 1, 0.2492301714584269],
[1.136945479087853, 3.834024317345556, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1220064587046763],
[1.917012158672778, 3.834024317345556, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1220064587046763],
[0.4102724655394217, 1.782375833079669, 0, 0, 0.1871127557473798, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.060037715064414, 0, 0, 0.1660813564064801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9975880386097585, 2.002411961390242, 0, 1, 0.3325293462032529, 0, 0.4993977359712317, 2.003761153992281, 0.6674706537967472, 1, 0.2492301714584269],
[0.8073517013809089, 2, 0, 0, 0.2875848084811677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[1.004334808361528, 1.994630829696156, 0, 2, 0.3348937365657839, 0, 1.002691811549239, 4.023155806866241, 0.4423663416594248, 1, 0.2492301714584269],
[0.7355989616317257, 2.264401038368273, 0, 0, 0.245199653877242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5507071956916371, 2.449292804308363, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9975876368227937, 2.002412363177207, 0, 1, 0.3325292122742645, 0, 0.4993976357663466, 2.00376075193468, 0.6674707877257355, 1, 0.2492301714584269],
[0.7364149323943427, 2.25337090727892, 0, 1, 0.2463102616322584, 0, 0.4437795823003501, 1.796280323058651, 0.7536897383677416, 1, 0.2470547478606769],
[1.007844400065903, 2.028911196535487, 0, 1, 0.3318819602057671, 0, 0.4928751941965585, 2.001819570565197, 0.6681180397942329, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4939482129147098, 2.006177651261629, 0.6666666666666667, 1, 0.2462135955926334],
[0.5969527969143669, 2.439802799687023, 0, 0, 0.1965758448201928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[0.5574543862017453, 2.479301210399644, 0, 0, 0.1835690652305457, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[0.5969527969143669, 2.439802799687023, 0, 0, 0.1965758448201928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.009811388034023, 2.026944208567367, 0, 1, 0.3325296870002187, 0, 0.4933534903295609, 2.003762177072572, 0.6674703129997812, 1, 0.2462135955926334],
[0.8158484815296219, 2.097298953112517, 1, 0, 0.2800573949082819, 1.225717792751315, 0, -4.978270147109569, 1, 0.2800573949082819, 0.2462135955926334],
[0.8172432658647099, 2.21951233073668, 0, 0, 0.2691172337936364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[1.012251865533797, 2.024503731067593, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2462135955926334],
[0.9995710788913281, 2.000428921108672, 1, 1, 0.3331903596304426, 1.000429105160933, 0.4998927927145658, -2.008329527349621, 0.8889841842493362, 0.5553649035102216, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.182809573061211, 0, 0, 0.1582180815848105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.5930820386006336, 2, 0, 0, 0.22871703624182, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.3734578143960003, 2.219624224204633, 0, 0, 0.1440208249629998, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269],
[0.9969924472802635, 2.003007552719736, 0, 1, 0.3323308157600878, 0, 0.4992492407940118, 2.003165338580565, 0.6676691842399122, 1, 0.2492301714584269],
[0.4102724655394217, 2.060037715064414, 0, 0, 0.1660813564064801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2492301714584269]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node104":{
"Global MG94xREV":0.002674775711608672,
"Nucleotide GTR":0.002757792582757957,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "F", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "TTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node141":{
"Global MG94xREV":0.001976534953292228,
"Nucleotide GTR":0.002037880563253985,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.002674386691454736,
"Nucleotide GTR":0.002757391488606248,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node161":{
"Global MG94xREV":0.002676610128959085,
"Nucleotide GTR":0.002759683934821872,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "V", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GTA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node206":{
"Global MG94xREV":0.005411538886590746,
"Nucleotide GTR":0.005579496530485032,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "R", "G", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTC", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "AGA", "GGT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node208":{
"Global MG94xREV":0.1012526131331313,
"Nucleotide GTR":0.1043951850884249,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "I", "L", "F", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "L", "Y", "H", "T", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "ACC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2.25, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 2, 1.5, 0, 0, 2.666666666666667, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0.75, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0.5, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node219":{
"Global MG94xREV":0.002674840778880453,
"Nucleotide GTR":0.002757859669519184,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGT", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.00267628581420665,
"Nucleotide GTR":0.002759349554329752,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAT", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node246":{
"Global MG94xREV":0.002676666518465492,
"Nucleotide GTR":0.002759742074486376,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node247":{
"Global MG94xREV":0.0008663166069761164,
"Nucleotide GTR":0.0008932044293171414,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.001812093633415156,
"Nucleotide GTR":0.001868335486899458,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node267":{
"Global MG94xREV":0.0026771125866629,
"Nucleotide GTR":0.002760201987278649,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "S", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "TCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node278":{
"Global MG94xREV":0.002679832003418414,
"Nucleotide GTR":0.00276300580642701,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "P", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CCA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node285":{
"Global MG94xREV":0.0009121594746330126,
"Nucleotide GTR":0.0009404701196132847,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node286":{
"Global MG94xREV":0.00125235971318798,
"Nucleotide GTR":0.001291229134833714,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node287":{
"Global MG94xREV":0.0005084765071345976,
"Nucleotide GTR":0.0005242580653759217,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.002675739888779557,
"Nucleotide GTR":0.002758786685044289,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.003999778321456342,
"Nucleotide GTR":0.004123919227961859,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "H", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CAT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node312":{
"Global MG94xREV":0.002516991286970913,
"Nucleotide GTR":0.002595111011345361,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node313":{
"Global MG94xREV":0.0001595199973580559,
"Nucleotide GTR":0.0001644710110108768,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.002190233799006662,
"Nucleotide GTR":0.002258211968649003,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321_1":{
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "F", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "R", "G", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "TTT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "AGA", "GGT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.0004868746718097842,
"Nucleotide GTR":0.0005019857750398853,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"Global MG94xREV":0.002676744877610679,
"Nucleotide GTR":0.00275982286566018,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTT", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node332":{
"Global MG94xREV":0.002676939143909143,
"Nucleotide GTR":0.002760023161391393,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "L", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CTA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node335":{
"Global MG94xREV":0.002675839384345156,
"Nucleotide GTR":0.002758889268648451,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "S", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "TCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node340":{
"Global MG94xREV":0.002675426844735682,
"Nucleotide GTR":0.002758463925069115,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node345":{
"Global MG94xREV":0.002675909985989643,
"Nucleotide GTR":0.002758962061552415,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node359":{
"Global MG94xREV":0.002590379844377096,
"Nucleotide GTR":0.002670777325494883,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node360":{
"Global MG94xREV":8.587761858692919e-05,
"Nucleotide GTR":8.854299765624605e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.002675177782880631,
"Nucleotide GTR":0.002758207133094545,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node369":{
"Global MG94xREV":0.002674913338876382,
"Nucleotide GTR":0.002757934481555842,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "G", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GGG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node373":{
"Global MG94xREV":0.002676191062777455,
"Nucleotide GTR":0.002759251862105502,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGT", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.002675239963526632,
"Nucleotide GTR":0.002758271243637944,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "V", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GTA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node379":{
"Global MG94xREV":0.00267728876321892,
"Nucleotide GTR":0.002760383631817044,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "F", "F", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "TTT", "TTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node382":{
"Global MG94xREV":0.002675076583984652,
"Nucleotide GTR":0.002758102793293831,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "V", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GTA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node385":{
"Global MG94xREV":0.00267617962657389,
"Nucleotide GTR":0.002759240070957101,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.001886645657410511,
"Nucleotide GTR":0.001945201378088644,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "S", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node396":{
"Global MG94xREV":0.002675936709604667,
"Nucleotide GTR":0.002758989614586855,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node400":{
"Global MG94xREV":0.002676179605261256,
"Nucleotide GTR":0.002759240048982991,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAT", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node403":{
"Global MG94xREV":0.002676244174582126,
"Nucleotide GTR":0.002759306622338427,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTT", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.002676179377443179,
"Nucleotide GTR":0.002759239814094133,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "C", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "TGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node409":{
"Global MG94xREV":0.002676244174582126,
"Nucleotide GTR":0.002759306622338427,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "I", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ATA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node412":{
"Global MG94xREV":0.002676244174460902,
"Nucleotide GTR":0.002759306622213439,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "L", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CTT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node415":{
"Global MG94xREV":0.002676244174582126,
"Nucleotide GTR":0.002759306622338427,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "L", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CTT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node418":{
"Global MG94xREV":0.002676244168249491,
"Nucleotide GTR":0.002759306615809244,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node421":{
"Global MG94xREV":0.002676244174582126,
"Nucleotide GTR":0.002759306622338427,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "S", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "TCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node424":{
"Global MG94xREV":0.002676244174460902,
"Nucleotide GTR":0.002759306622213439,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "L", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TTA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node427":{
"Global MG94xREV":0.002674727376791483,
"Nucleotide GTR":0.002757742747775624,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATT", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node430":{
"Global MG94xREV":0.00267631955310715,
"Nucleotide GTR":0.002759384340382713,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "S", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "TCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node433":{
"Global MG94xREV":0.002675301787105578,
"Nucleotide GTR":0.002758334986032015,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node438":{
"Global MG94xREV":0.002676318212583715,
"Nucleotide GTR":0.002759382958253524,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "L", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CTA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node449":{
"Global MG94xREV":0.002676154291039898,
"Nucleotide GTR":0.00275921394908549,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node460":{
"Global MG94xREV":0.002676355741778096,
"Nucleotide GTR":0.002759421652239509,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "TTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node469":{
"Global MG94xREV":0.002677148091372408,
"Nucleotide GTR":0.002760238593945934,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "F", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TTT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node483":{
"Global MG94xREV":0.001881661900983928,
"Nucleotide GTR":0.001940062941079568,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "V", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GTT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node490":{
"Global MG94xREV":0.00267542738456629,
"Nucleotide GTR":0.002758464481654419,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node494":{
"Global MG94xREV":0.002677055442131926,
"Nucleotide GTR":0.002760143069155915,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "D", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAT", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node497":{
"Global MG94xREV":0.002674686231163515,
"Nucleotide GTR":0.002757700325112996,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "I", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ATT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node82":{
"Global MG94xREV":0.001696004487722983,
"Nucleotide GTR":0.001748643288582003,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node83":{
"Global MG94xREV":0.0009790101514857263,
"Nucleotide GTR":0.001009395637359178,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node90":{
"Global MG94xREV":0.001854424849039476,
"Nucleotide GTR":0.001911980534206127,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node91":{
"Global MG94xREV":0.002175423597750044,
"Nucleotide GTR":0.002242942103965626,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "-", "I", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "---", "ATT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node92":{
"Global MG94xREV":0.003016575865793508,
"Nucleotide GTR":0.003110201170104355,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808244290461863,
"Nucleotide GTR":0.002759562669458709,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Q", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAG", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGT", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "SL", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TYA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "YSCWLF", "DAV", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TNN", "GHT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807252241083335,
"Nucleotide GTR":0.002758587817505642,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "S", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TCT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005628841351600671,
"Nucleotide GTR":0.005531263971208156,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "F", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCT", "TTT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002804077718848264,
"Nucleotide GTR":0.002755468326411862,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "D", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAT", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002807369544070174,
"Nucleotide GTR":0.002758703087015708,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAC", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "P", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CCA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002822000239596984,
"Nucleotide GTR":0.002773080155756176,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTG", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417245_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "SL", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TYA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417245_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "EG", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GRG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807429153057617,
"Nucleotide GTR":0.002758761662666357,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "I", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ATT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008320025785279752,
"Nucleotide GTR":0.0008175796045940091,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "V", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GTT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002822305736306467,
"Nucleotide GTR":0.002773380356603374,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "R", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "CGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTY", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418691_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QH", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAW", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807454815174783,
"Nucleotide GTR":0.002758786879924272,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "P", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CCG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "IL", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "WTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "AV", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GYT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807642119496385,
"Nucleotide GTR":0.002758970937278357,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAC", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419708_Virginia_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "IM", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AT-", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419708_Virginia_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "PS", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "YCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805143221634061,
"Nucleotide GTR":0.002756515358438906,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "V", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "GTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420739_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATY", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420739_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807330763589178,
"Nucleotide GTR":0.002758664978804104,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807050365243404,
"Nucleotide GTR":0.002758389441234166,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAC", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13":{
"Global MG94xREV":0.002808418788078426,
"Nucleotide GTR":0.002759734142115206,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "S", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "TCA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807438656822417,
"Nucleotide GTR":0.002758771001681007,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "F", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TTT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421884_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00280886261267161,
"Nucleotide GTR":0.002760170272897453,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "C", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "TGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421884_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421901_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "ED", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAK", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421901_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808862612641674,
"Nucleotide GTR":0.002760170272868036,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "S", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "TCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "AS", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "KCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002813919948098737,
"Nucleotide GTR":0.002765139938143113,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "L", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAY", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002808862612656835,
"Nucleotide GTR":0.002760170272882932,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "F", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TTT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002809603479111468,
"Nucleotide GTR":0.002760898296231262,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "R", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "AGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002837113091307865,
"Nucleotide GTR":0.00278793102238201,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "I", "-", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "ATT", "---", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801459922206408,
"Nucleotide GTR":0.002752895909933121,
"amino-acid": [
["M", "R", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AGA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "TP", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "MCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "TI", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "AYT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGY", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423270_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423333_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "ED", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CT-", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAK", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423333_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "AV", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GYA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "S", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "TCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTY", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423562_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "KN", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAM", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "SI", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AKC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423634_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423669_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "HY", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "YAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423669_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423756_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807277358138174,
"Nucleotide GTR":0.002758612499150022,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "A", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GCA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423756_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTY", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423805_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "KAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423805_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "KR", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCY", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ARA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423807_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "ED"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAW"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_423881_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423934_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "TI", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "AYA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423934_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "CF", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TKC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424015_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808140602192968,
"Nucleotide GTR":0.002759460778652033,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "H", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "CAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424015_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "G", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GGG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808862610567331,
"Nucleotide GTR":0.002760170270829652,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "H", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAT", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8":{
"Global MG94xREV":0.00281074961538647,
"Nucleotide GTR":0.002762024563945701,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "T", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "ACT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003645240749264683,
"Nucleotide GTR":0.003582049584157118,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "SL", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TYA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002812518139637956,
"Nucleotide GTR":0.002763762430384531,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "SL", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "R", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TYA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "L", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TTA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "PL", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CYT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002813661690823524,
"Nucleotide GTR":0.002764886157822712,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "Q", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CAA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "S", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "TCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002805689985567542,
"Nucleotide GTR":0.0027570526440821,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACG", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002813165969679845,
"Nucleotide GTR":0.002764399030129725,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGA", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427720_New_South_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "L", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CTT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427720_New_South_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806167370052861,
"Nucleotide GTR":0.002757521752987309,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACG", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002810584608857844,
"Nucleotide GTR":0.002761862417846745,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "K", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AAA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808108264019548,
"Nucleotide GTR":0.002759429001068981,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "TTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTT", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "TI", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "AYA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428954_Luxembourg_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002806569997505802,
"Nucleotide GTR":0.002757917400792102,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "T", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ACA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428954_Luxembourg_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801685316634014,
"Nucleotide GTR":0.002753117397091641,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "P", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CCT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808811472249281,
"Nucleotide GTR":0.002760120019007205,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "D", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAT", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002807608912212538,
"Nucleotide GTR":0.002758938305651128,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "S", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "TCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002806353419929587,
"Nucleotide GTR":0.002757704577642635,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "V", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GTA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002810455618512637,
"Nucleotide GTR":0.00276173566358161,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "I", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "ATA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002821901141047297,
"Nucleotide GTR":0.002772982775104769,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "Q", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "CAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGR", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TWA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "YAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "KAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TKA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "PL", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CYA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "KR", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ARA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002822301928077977,
"Nucleotide GTR":0.002773376614391483,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "D", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAC", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805672315672656,
"Nucleotide GTR":0.002757035280499283,
"amino-acid": [
["M", "E", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "GAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808121970575694,
"Nucleotide GTR":0.002759442470018532,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "S", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "AGT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807243917503886,
"Nucleotide GTR":0.002758579638217538,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "P", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CCG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTY", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAY", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432501_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807805026274361,
"Nucleotide GTR":0.002759131020026366,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "A", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GCT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432501_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432607_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806822665503503,
"Nucleotide GTR":0.002758165688726523,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432607_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_432743_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002806715580787449,
"Nucleotide GTR":0.002758060460350948,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "L", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "CTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432743_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432806_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807512199146682,
"Nucleotide GTR":0.002758843269130587,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "F", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "TTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432806_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433029_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "C", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "TGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433029_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00086102123169136,
"Nucleotide GTR":0.0008460952121070834,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806356957471057,
"Nucleotide GTR":0.002757708053859933,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGC", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806230878099288,
"Nucleotide GTR":0.002757584160105781,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "A", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "GCA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433767_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002807167565766028,
"Nucleotide GTR":0.002758504610056257,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "P", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CCT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433767_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433872_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808883225145411,
"Nucleotide GTR":0.002760190528048841,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "S", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "TCT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433872_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002808108101423415,
"Nucleotide GTR":0.002759428841291493,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGT", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00437517275543044,
"Nucleotide GTR":0.004299328035429912,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "H", "-", "-", "-", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAT", "---", "---", "---", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002813007812205261,
"Nucleotide GTR":0.002764243614354736,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "D", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GAT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808122022116903,
"Nucleotide GTR":0.002759442520666264,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCG", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002809603481245554,
"Nucleotide GTR":0.002760898298328355,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "H", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CAT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002811378138303165,
"Nucleotide GTR":0.00276264219125957,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "H", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAC", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00282686842994998,
"Nucleotide GTR":0.002777863954805134,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "L", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "QPRL", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "NTSI", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTA", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CNG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ANC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002820770337598599,
"Nucleotide GTR":0.002771871574418233,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "Q", "L", "F", "I", "R", "QPRL", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "EAGV", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "CAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CNA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GNA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "AV", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GYA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806728366188711,
"Nucleotide GTR":0.002758073024114061,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "A", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "GCA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436056_New_York_20200309_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436056_New_York_20200309_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTK", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436208_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005510785532224813,
"Nucleotide GTR":0.0005415254679150312,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "-", "I", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "---", "ATT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436208_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QL", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CWA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "TI", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "AYW", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0]
],
"original name":"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0]
]
},
"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "LF", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "YTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808121970594104,
"Nucleotide GTR":0.002759442470036624,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "V", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "GTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002808548313527188,
"Nucleotide GTR":0.002759861422207742,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "L", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "TTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "F", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TTT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437079_California_20200426_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002808108264019548,
"Nucleotide GTR":0.002759429001068981,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "F", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TTT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437079_California_20200426_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGT", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "L", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CTT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437601_Kanto_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "SC", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "WGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437601_Kanto_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806876470715569,
"Nucleotide GTR":0.002758218561211707,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "V", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GTG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437666_Unknown_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002808470201043354,
"Nucleotide GTR":0.002759784663823459,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "I", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ATA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437666_Unknown_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTY", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438177_Washington_20200418_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0007322750182922527,
"Nucleotide GTR":0.0007195808466948394,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438177_Washington_20200418_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "I", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ATT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "ED", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAK", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438355_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438382_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "YAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438382_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438560_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807490073734853,
"Nucleotide GTR":0.002758821527268336,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTC", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438560_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002807533120893671,
"Nucleotide GTR":0.002758863828193834,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "F", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTT", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805672314829491,
"Nucleotide GTR":0.002757035279670738,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "S", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AGC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439015_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "L", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CTA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439015_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805984625185821,
"Nucleotide GTR":0.002757342176048497,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "C", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TGT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439314_Scotland_20200428_null_9":{
"Global MG94xREV":0.002808778395112965,
"Nucleotide GTR":0.002760087515271367,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "L", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "TTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439314_Scotland_20200428_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439443_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002807508827418008,
"Nucleotide GTR":0.002758839955851682,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439443_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439658_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "H", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "CAT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439658_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439787_England_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002806972536101011,
"Nucleotide GTR":0.002758312961279531,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCC", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439787_England_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439956_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "V", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GTA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439956_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440237_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "LF", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "YTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440237_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440408_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.008553615062387823,
"Nucleotide GTR":0.008405335994185557,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "HPRL", "Y", "-", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "C-C", "TAT", "---", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440408_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440445_England_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":0.002808821702549794,
"Nucleotide GTR":0.002760130071962888,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "F", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "TTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440445_England_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440448_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "NTSI", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "A-C", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440448_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440558_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "L", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CTA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440558_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440595_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGY", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440595_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440685_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACR", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440685_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440705_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "HY", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "YAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440705_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440854_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001587859981319879,
"Nucleotide GTR":0.001560334029222609,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "SRGC", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-GT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440854_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440924_England_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002808547919904933,
"Nucleotide GTR":0.002759861035409026,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "S", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "TCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440924_England_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441000_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002807384388776349,
"Nucleotide GTR":0.002758717674385167,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "P", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CCC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441000_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441109_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "YAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441109_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441318_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "LF", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "YTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441318_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "PS", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "YCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441452_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATT", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441452_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441559_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "KQ", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "MAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441559_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "PL", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CYA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441821_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCY", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441821_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441889_England_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "CT-", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441889_England_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441897_England_20200430_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002808899651221941,
"Nucleotide GTR":0.0027602066693752,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "I", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "ATA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441897_England_20200430_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808108264019548,
"Nucleotide GTR":0.002759429001068981,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "S", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "TCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441918_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441979_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002815947216923069,
"Nucleotide GTR":0.002767132063752555,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "H", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CAT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441979_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "AS", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "KCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442260_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442331_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806806503472493,
"Nucleotide GTR":0.002758149806868382,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "V", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "GTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442331_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442342_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "TI", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "AYA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442342_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442435_England_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002807292371913637,
"Nucleotide GTR":0.002758627252657907,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "S", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "TCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442435_England_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442504_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002808844651824165,
"Nucleotide GTR":0.002760152623405813,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442504_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442508_England_20200411_null_33":{
"Global MG94xREV":0.002807429152645825,
"Nucleotide GTR":0.002758761662261706,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAT", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442508_England_20200411_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442513_England_20200408_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "D", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAT", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442513_England_20200408_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "PS", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "YCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442537_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442776_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00280709923527365,
"Nucleotide GTR":0.002758437464090146,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "I", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ATA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442776_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442851_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00282229001465328,
"Nucleotide GTR":0.002773364907488998,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "N", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAC", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442851_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442912_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002808121970567625,
"Nucleotide GTR":0.002759442470010601,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "R", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CGT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442912_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442937_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAY", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442937_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807806321536481,
"Nucleotide GTR":0.002759132292834791,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "H", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "CAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442948_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443024_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808080375856099,
"Nucleotide GTR":0.002759401596353859,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "V", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "GTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443024_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "PL", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CYT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443293_Bretagne_20200403_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "S", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "TCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443293_Bretagne_20200403_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002810878315371855,
"Nucleotide GTR":0.002762151032884472,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "Q", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "CAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443449_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00282171184908028,
"Nucleotide GTR":0.002772796764561604,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QHPRL", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "C--", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTA", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443449_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443571_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443571_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443595_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002808698814311992,
"Nucleotide GTR":0.002760009314023591,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "F", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "TTT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443595_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443609_England_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002808108263750329,
"Nucleotide GTR":0.002759429000804434,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "F", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TTT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443609_England_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443618_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002808263677987554,
"Nucleotide GTR":0.002759581720896766,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "S", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "TCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443618_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443707_England_20200327_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443707_England_20200327_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443813_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002807284759864264,
"Nucleotide GTR":0.002758619772565328,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTT", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443813_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443844_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAR", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443844_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443983_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008271391134081585,
"Nucleotide GTR":0.0008128004488651262,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "S", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443983_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443996_England_20200328_null_11":{
"Global MG94xREV":0.002806857621073973,
"Nucleotide GTR":0.002758200038333384,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAT", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443996_England_20200328_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444010_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002811378138294664,
"Nucleotide GTR":0.002762642191251219,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACC", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444010_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "V", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GTA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444058_California_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444094_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002815690744109588,
"Nucleotide GTR":0.002766880036959794,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "K", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "AAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444094_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444174_England_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002807642119518874,
"Nucleotide GTR":0.002758970937300455,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAC", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444174_England_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444192_England_20200414_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444192_England_20200414_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444262_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807519760734642,
"Nucleotide GTR":0.002758850699636518,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444262_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444295_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "TTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444295_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808862612641674,
"Nucleotide GTR":0.002760170272868036,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "I", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "ATA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444342_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444361_England_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002813007812205261,
"Nucleotide GTR":0.002764243614354736,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "N", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "AAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444361_England_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444419_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "S", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "TCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444419_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_87":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_87",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444612_Queensland_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002807618450090704,
"Nucleotide GTR":0.002758947678187774,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "TTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444612_Queensland_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807642119470387,
"Nucleotide GTR":0.002758970937252806,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "P", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "CCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808108263500435,
"Nucleotide GTR":0.002759429000558865,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGT", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807360621877227,
"Nucleotide GTR":0.002758694319491217,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "L", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CTT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808108263969617,
"Nucleotide GTR":0.002759429001019918,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "S", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "TCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002807608912212538,
"Nucleotide GTR":0.002758938305651128,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "L", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "TTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "F", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "TTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445130_Louisiana_20200331_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAT", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445130_Louisiana_20200331_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445135_Louisiana_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "I", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ATA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445135_Louisiana_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTT", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AC-", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.04043185420930139,
"Nucleotide GTR":0.03973095784862612,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "KTRI", "I", "I", "L", "F", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "A-A", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445228_Uppsala_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00280723982912774,
"Nucleotide GTR":0.002758575620714422,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445228_Uppsala_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002813470079093969,
"Nucleotide GTR":0.002764697867730681,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "I", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "ATT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445305_Santiago_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "V", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GTA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445305_Santiago_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "KAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805672315672175,
"Nucleotide GTR":0.002757035280498812,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGG", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002808862613172669,
"Nucleotide GTR":0.002760170273389827,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCT", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002807642119506731,
"Nucleotide GTR":0.002758970937288524,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "P", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "CCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002807608912212538,
"Nucleotide GTR":0.002758938305651128,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "I", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "ATA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807641821558685,
"Nucleotide GTR":0.002758970644505481,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCC", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806480114752314,
"Nucleotide GTR":0.002757829076178747,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "TTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "EV", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GWG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "RC", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "YGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "LF", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "YTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0029711877470505,
"Nucleotide GTR":0.002919681460249742,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "VF", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "KTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446111_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002810802787226967,
"Nucleotide GTR":0.002762076814038969,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "T", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "ACA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446111_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "ILVF", "F", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "NTT", "TTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "KN", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAK", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.5529545286099736,
"Nucleotide GTR":0.5433689227974039,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "K", "KNTRSIM", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AAA", "A??", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 13.5, 0]
],
"original name":"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 9.5, 0]
]
},
"epi_isl_446470_Wales_20200412_null_106":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446470_Wales_20200412_null_106",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002803267539515436,
"Nucleotide GTR":0.002754672191741512,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "V", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GTG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00280711746787456,
"Nucleotide GTR":0.002758455380624334,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "CTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002813054082192254,
"Nucleotide GTR":0.002764289082239873,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "T", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "ACT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446923_Wales_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "TI", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "AYA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446923_Wales_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14":{
"Global MG94xREV":0.002807611082716822,
"Nucleotide GTR":0.00275894043852917,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTY", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_22398":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_22398",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAT", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":4688.345103567287,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02970965140338901],
[0.0129563437790079],
[0.00880862238653555],
[0.02790521180794894],
[0.02462470003378863],
[0.01073880251103582],
[0.007300983812775742],
[0.02312909905337006],
[0.01429648188990258],
[0.006234678814669935],
[0.004238767689133193],
[0.01342817355308079],
[0.03357423675340935],
[0.01464168487164924],
[0.009954434317031084],
[0.03153507845559034],
[0.02422124714305914],
[0.01056285718337272],
[0.007181363958710846],
[0.0227501501987547],
[0.02007566286267682],
[0.008754972790109275],
[0.005952238581181844],
[0.01885635131700222],
[0.01165542524986003],
[0.005082917142894832],
[0.003455720108812763],
[0.01094752361422723],
[0.02737190938400387],
[0.01193685725395459],
[0.00811550463815457],
[0.02570945443208679],
[0.02778796660414378],
[0.01211829931474081],
[0.008238861553173309],
[0.02610024208201884],
[0.02303192093657219],
[0.01004419343375799],
[0.006828740317823586],
[0.0216330586768738],
[0.013371754381071],
[0.005831406243623854],
[0.003964594985955332],
[0.01255961011394065],
[0.03140258217761963],
[0.01369462888397859],
[0.009310559878640949],
[0.02949532106872981],
[0.0146396609310559],
[0.03153071931755671],
[0.02782399611900625],
[0.01213401174348697],
[0.008249543953544972],
[0.02613408331529093],
[0.007044702226000555],
[0.004789477864501136],
[0.01517279188431105],
[0.03793627665894991],
[0.01654396530660203],
[0.01124773667999731],
[0.03563218635585165]
],
"Log Likelihood":-2003.574080816309,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.9457592834357216, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.8841320363707789, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":337
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5099.803945893523,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2948360228110889],
[0.2170012772770612],
[0.1650089049597928],
[0.3231537949520571]
],
"Log Likelihood":-2026.052830951664,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3388220417314615,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.5064453763785909,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3523602733727208,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.049528893501278,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.294050897789535
},
"display order":0,
"estimated parameters":521
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-16/sequences.ORF7a.compressed.fas",
"number of sequences":258,
"number of sites":124,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_423634_England_20200321_null_1,epi_isl_423934_England_20200319_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_423805_England_20200324_null_1,epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1,epi_isl_438382_England_20200331_null_1,epi_isl_423562_England_20200401_null_1,epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_440685_England_20200405_null_1,epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1,epi_isl_441559_England_20200406_null_1,(epi_isl_440558_England_20200402_null_3,epi_isl_441798_England_20200403_null_1)Node438,(epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1,epi_isl_443595_England_20200415_null_3,epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_11)Node433,(epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1,epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4)Node430,(epi_isl_420739_England_20200327_null_1,epi_isl_441452_England_20200409_null_2)Node427,(epi_isl_417245_England_20200302_null_1,epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1)Node424,(epi_isl_442537_England_20200408_null_1,epi_isl_443293_Bretagne_20200403_null_5)Node421,(epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1,epi_isl_436056_New_York_20200309_null_4)Node418,(epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_427720_New_South_Wales_20200318_null_1)Node415,(epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1,epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1)Node412,(epi_isl_445135_Louisiana_20200401_null_6,epi_isl_446923_Wales_20200416_null_3)Node409,(epi_isl_433029_England_20200403_null_2,epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2)Node406,(epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1,epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4)Node403,(epi_isl_423669_England_20200320_null_1,epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4)Node385,(epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_439956_England_20200323_null_1)Node382,(epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1,epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8)Node379,(epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1,epi_isl_444058_California_20200428_null_1)Node376,(epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1,epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3)Node340,(epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1,epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_443707_England_20200327_null_32)Node345,epi_isl_440237_England_20200323_null_1,epi_isl_432743_England_20200403_null_3,epi_isl_443024_England_20200411_null_1,epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1,epi_isl_442331_England_20200403_null_1,((epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3)Node360,epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3)Node359,(epi_isl_442342_England_20200405_null_1,epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12)Node364,epi_isl_442435_England_20200331_null_5,(epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1)Node335,epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3,epi_isl_418731_England_20200313_null_1,(epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3,(epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1,epi_isl_439658_England_20200324_null_1)Node303,epi_isl_441889_England_20200430_null_2)Node301,epi_isl_445228_Uppsala_20200401_null_2,((epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_446470_Wales_20200412_null_106,epi_isl_418691_England_20200317_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1)Node313,epi_isl_443844_England_20200326_null_2)Node312,((epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1,epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12)Node322,epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1)Node321,(epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1,epi_isl_438560_England_20200419_null_1,epi_isl_443449_England_20200413_null_1)Node327,(epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_439015_Scotland_20200424_null_1)Node332,(epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_423270_England_20200326_null_1)Node373,(epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1,epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1)Node369,epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1,epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1,(((epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_87)Node287,epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1)Node286,epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2)Node285,epi_isl_443813_England_20200326_null_5,epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1,(epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1)Node278,epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_22398,(epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_445130_Louisiana_20200331_null_14)Node400,epi_isl_442508_England_20200411_null_33,epi_isl_441109_England_20200402_null_1,epi_isl_444094_England_20200406_null_2,(epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2,epi_isl_443983_England_20200329_null_2)Node391,epi_isl_423055_England_20200319_null_1,(epi_isl_423333_England_20200327_null_2,epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1)Node396,epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1,(epi_isl_442260_England_20200405_null_2,epi_isl_444419_England_20200420_null_1)Node267,epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1,epi_isl_442776_England_20200406_null_4,epi_isl_433767_England_20200406_null_2,epi_isl_436957_LA_20200406_null_5,epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2,epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2,epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1,(((epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1)Node248,epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1)Node247,epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1)Node246,epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1,epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_2,epi_isl_446111_Wales_20200407_null_4,epi_isl_442948_England_20200411_null_1,epi_isl_444361_England_20200429_null_2,epi_isl_432806_England_20200320_null_1,epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1,epi_isl_441897_England_20200430_null_4,epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_441918_England_20200410_null_1,epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1,epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3,epi_isl_444174_England_20200411_null_3,(epi_isl_423756_England_20200324_null_1,epi_isl_445305_Santiago_20200316_null_6)Node161,epi_isl_443996_England_20200328_null_11,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1,(epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1,epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17)Node156,epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1,(epi_isl_438177_Washington_20200418_null_10,epi_isl_441821_England_20200403_null_1)Node141,epi_isl_442851_England_20200409_null_4,epi_isl_437666_Unknown_20200327_null_3,epi_isl_423807_England_20200324_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1,epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1,epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1,epi_isl_430903_USA_20200405_null_1,epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3,epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3,epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4,epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_437079_California_20200426_null_5,epi_isl_444342_England_20200427_null_1,epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_442912_England_20200409_null_2,epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1,epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2,epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1,(epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1,epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1)Node228,epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_433872_England_20200408_null_1,epi_isl_444612_Queensland_20200323_null_6,(epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1,epi_isl_440595_England_20200403_null_2)Node219,epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_2,epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_440445_England_20200314_null_8,(epi_isl_440854_England_20200417_null_2,(epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1,epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1)Node208,epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2)Node206,epi_isl_440408_England_20200314_null_1,epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3,epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4,epi_isl_421884_England_20200327_null_1,epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1,epi_isl_423881_England_20200318_null_1,epi_isl_432607_England_20200404_null_1,epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1,epi_isl_442937_England_20200410_null_1,(epi_isl_440705_England_20200403_null_1,epi_isl_424015_England_20200319_null_1,epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4)Node449,epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,(epi_isl_444295_England_20200324_null_1,epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_441318_England_20200403_null_2)Node460,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_421901_England_20200326_null_1,(epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1,epi_isl_436958_LA_20200406_null_1)Node469,epi_isl_437601_Kanto_20200331_null_1,epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1,epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1,(epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_4)Node497,(epi_isl_438355_England_20200329_null_1,epi_isl_442513_England_20200408_null_13)Node494,epi_isl_439787_England_20200412_null_3,epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8,(epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2,epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3)Node483,epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2,(epi_isl_444192_England_20200414_null_17,epi_isl_444262_England_20200418_null_1)Node490,epi_isl_439443_England_20200401_null_4,epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1,epi_isl_443609_England_20200414_null_6,epi_isl_432501_England_20200330_null_1,epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2,epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13,epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_1,epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1,epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1,epi_isl_441979_England_20200411_null_1,epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1,epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2,epi_isl_444010_England_20200325_null_3,epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1,epi_isl_441000_England_20200402_null_2,(epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4,epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1)Node104,epi_isl_443618_England_20200414_null_3,epi_isl_428954_Luxembourg_20200405_null_4,epi_isl_440924_England_20200424_null_3,epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_439314_Scotland_20200428_null_9,epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1,((epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_442504_England_20200409_null_4,epi_isl_443571_England_20200414_null_5)Node83,epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1)Node82,(((epi_isl_419708_Virginia_20200312_null_1,epi_isl_440448_England_20200311_null_1)Node92,epi_isl_436208_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1)Node91,epi_isl_433051_England_20200404_null_1)Node90,epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node104":"test",
"Node141":"test",
"Node156":"test",
"Node161":"test",
"Node206":"test",
"Node208":"test",
"Node219":"test",
"Node228":"test",
"Node246":"test",
"Node247":"test",
"Node248":"test",
"Node267":"test",
"Node278":"test",
"Node285":"test",
"Node286":"test",
"Node287":"test",
"Node301":"test",
"Node303":"test",
"Node312":"test",
"Node313":"test",
"Node321":"test",
"Node322":"test",
"Node327":"test",
"Node332":"test",
"Node335":"test",
"Node340":"test",
"Node345":"test",
"Node359":"test",
"Node360":"test",
"Node364":"test",
"Node369":"test",
"Node373":"test",
"Node376":"test",
"Node379":"test",
"Node382":"test",
"Node385":"test",
"Node391":"test",
"Node396":"test",
"Node400":"test",
"Node403":"test",
"Node406":"test",
"Node409":"test",
"Node412":"test",
"Node415":"test",
"Node418":"test",
"Node421":"test",
"Node424":"test",
"Node427":"test",
"Node430":"test",
"Node433":"test",
"Node438":"test",
"Node449":"test",
"Node460":"test",
"Node469":"test",
"Node483":"test",
"Node490":"test",
"Node494":"test",
"Node497":"test",
"Node82":"test",
"Node83":"test",
"Node90":"test",
"Node91":"test",
"Node92":"test",
"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1":"background",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1":"background",
"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1":"background",
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_2":"background",
"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_417245_England_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_419708_Virginia_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1":"background",
"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_420739_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13":"background",
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421884_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421901_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423333_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_423669_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_423756_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_423805_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423934_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424015_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8":"background",
"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2":"background",
"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_427720_New_South_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1":"background",
"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_428954_Luxembourg_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4":"background",
"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3":"background",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432501_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432607_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432743_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_432806_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_433029_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433767_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_433872_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436056_New_York_20200309_null_4":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436208_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437079_California_20200426_null_5":"background",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437346_Kinshasa_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_437601_Kanto_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_437666_Unknown_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17":"background",
"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438177_Washington_20200418_null_10":"background",
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_4":"background",
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438382_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438560_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_439015_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_439314_Scotland_20200428_null_9":"background",
"epi_isl_439443_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_439658_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439787_England_20200412_null_3":"background",
"epi_isl_439956_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440237_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440408_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440445_England_20200314_null_8":"background",
"epi_isl_440448_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_440558_England_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_440595_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440685_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_440705_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440854_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_440924_England_20200424_null_3":"background",
"epi_isl_441000_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441109_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441318_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_441452_England_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_441559_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441821_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441889_England_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_441897_England_20200430_null_4":"background",
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_441979_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442331_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442342_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442435_England_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_442504_England_20200409_null_4":"background",
"epi_isl_442508_England_20200411_null_33":"background",
"epi_isl_442513_England_20200408_null_13":"background",
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442776_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442851_England_20200409_null_4":"background",
"epi_isl_442912_England_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_442937_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443024_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443293_Bretagne_20200403_null_5":"background",
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443449_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443571_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443595_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_443609_England_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_443618_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_443707_England_20200327_null_32":"background",
"epi_isl_443813_England_20200326_null_5":"background",
"epi_isl_443844_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_443983_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_443996_England_20200328_null_11":"background",
"epi_isl_444010_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444094_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_444174_England_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_444192_England_20200414_null_17":"background",
"epi_isl_444262_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444295_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444361_England_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_444419_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_87":"background",
"epi_isl_444612_Queensland_20200323_null_6":"background",
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12":"background",
"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4":"background",
"epi_isl_445130_Louisiana_20200331_null_14":"background",
"epi_isl_445135_Louisiana_20200401_null_6":"background",
"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445228_Uppsala_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_445305_Santiago_20200316_null_6":"background",
"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3":"background",
"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12":"background",
"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_446111_Wales_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8":"background",
"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446470_Wales_20200412_null_106":"background",
"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4":"background",
"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_446923_Wales_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14":"background",
"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_22398":"background",
"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_11":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":8
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":11
}
}
}